【摘 要】
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目的利用生物信息学分析三阴性乳腺癌肿瘤组织和正常乳腺组织的基因表达差异,筛选出具有潜在临床应用价值的关键基因,为TNBC的治疗和预后提供新的策略。资料与方法对GEO数据库中TNBC相关的数据集及TCGA中的TNBC数据集进行分析,并从中筛选出肿瘤组织与正常组织之间的差异表达基因。然后,使用生物信息学工具进行功能注释、通路富集分析。接下来,构建蛋白质-蛋白质相互作用网络并进行可视化分析,对筛选出来的
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目的利用生物信息学分析三阴性乳腺癌肿瘤组织和正常乳腺组织的基因表达差异,筛选出具有潜在临床应用价值的关键基因,为TNBC的治疗和预后提供新的策略。资料与方法对GEO数据库中TNBC相关的数据集及TCGA中的TNBC数据集进行分析,并从中筛选出肿瘤组织与正常组织之间的差异表达基因。然后,使用生物信息学工具进行功能注释、通路富集分析。接下来,构建蛋白质-蛋白质相互作用网络并进行可视化分析,对筛选出来的基因再进行生存分析,找出与癌症无复发生存期相关的基因并初步利用基因集富集分析验证目的基因的病理生理功能。最后,从临床收集了25例TNBC病人的肿瘤组织标本和正常乳腺组织标本,利用PCR验证目的基因的表达量。结果分析发现以下5个基因:CCNB1,GINS2,NCAPG,MCM4,RRM2在三阴性乳腺癌肿瘤组织中高表达,它们不同程度地参与了肿瘤的增殖、侵袭、耐药等病理过程,同时,它们的高表达也与不良预后相关。最后,PCR实验证明CCNB1,NCAPG,MCM4和RRM2在临床TNBC患者的肿瘤组织内高表达。结论本研究发现并证实了三阴性乳腺癌中和肿瘤发生发展密切相关的4个关键基因:CCNB1,NCAPG,MCM4和RRM2。它们或可成为未来TNBC预后评估的参考指标,为肿瘤的治疗提供潜在的分子治疗靶点。但本研究仍存在组织样本量较小,需要进一步实验验证具体的分子机制等不足。
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