水稻无侧根突变体RM109的遗传分析与基因定位

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水稻根系在其生长过程中起着相当重要的作用,侧根是水稻根系的重中之重,发达根系对水稻抵抗不良环境条件具有决定性作用。本研究通过测定不同氮素水平下无侧根突变体RM109与原品种日本大力的最大分蘖数、株高、穗数、穗长、每穗粒数、每穗实粒数和结实率;测定RM109、密阳23号以及RM109/密阳23号杂交后代F1、F2群体苗期的最大根长、不定根数、侧根数。对比分析同种氮素水平下RM109与原品种日本大力的各农艺性状以及不同氮素水平下二者各农艺性状差值的差异显著性。利用F2群体分析水稻苗期根部相关性状最大根长、不定根数和侧根数的相关性,并按照侧根数表型对F2群体进行分类。利用RM109、密阳23号以及RM109/密阳23号杂交后代F1、F2群体对无侧根突变性状进行遗传分析与基因定位。此外,利用RM109与原品种日本大力对定位位点附近相关的生长素基因进行了测序比对分析,主要结果如下:1.同种氮素水平下,无侧根突变体RM109的最大分蘖数、株高、穗数、穗长、每穗粒数、每穗实粒数与原品种日本大力均存在极显著差异,表明侧根与各主要农艺性状(包括产量相关性状)密切相关。高低2种不同氮素水平下RM109的最大分蘖数、穗数、每穗粒数和每穗实粒数性状差值与日本大力显著差异,表明侧根直接影响水稻对氮素的响应与吸收。2.无侧根突变体RM109与密阳23号构建的F2代分离群体,侧根数分布非正态分布,且与最大根长和不定根数均呈极显著负相关,而最大根长与不定根数分布为正态分布,属于数量性状,且二者之间呈显著正相关性。3.F2代群体,按照侧根数可明显分成三类:正常侧根类型、少侧根类型和无侧根类型。卡方测验三种类型比例大致符合1:2:1,表明无侧根突变性状是由单基因控制,且遗传方式为不完全显性。4.控制无侧根突变性状的基因,初步定位在第3染色体标记区间RM15879-RM5475,其区间大小约3.1cM,具体物理距离约为450kb。5.利用RM109与原品种日本大力对基因定位位点附近相关生长素基因进行测序比对分析,在基因OsIAA13的启动子区域内,二者之间存在若干碱基差异,推测:RM109的无侧根突变性状极有可能是由生长素基因OsIAA13启动子区域内基因突变所致。
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