【摘 要】
:
背景TSPAN6(Transmembrane 4 Superfamily Member 6)编码的蛋白质是跨膜超家族(Transmembrane 4 Superfamily)的成员之一,该家族也被称为四氨蛋白家族。TSPAN蛋白家族是一个跨膜糖蛋白家族,其特征是结构上存在四个疏水结构域、三个细胞内小区域和两个细胞外环(EC1和EC2),其中可变的EC2区域包含特定的位点,以促进与伙伴蛋白的相互作用
论文部分内容阅读
背景TSPAN6(Transmembrane 4 Superfamily Member 6)编码的蛋白质是跨膜超家族(Transmembrane 4 Superfamily)的成员之一,该家族也被称为四氨蛋白家族。TSPAN蛋白家族是一个跨膜糖蛋白家族,其特征是结构上存在四个疏水结构域、三个细胞内小区域和两个细胞外环(EC1和EC2),其中可变的EC2区域包含特定的位点,以促进与伙伴蛋白的相互作用。TSPAN蛋白可以在细胞表面建立独特的平台,称为TSPAN富集微域(TEMs)。在该区域中,TSPAN蛋白与其他家族蛋白相配合,可以结合整合素、粘附分子、生长因子受体、金属蛋白酶、细胞内信号分子,甚至TSPAN家族成员,发挥调节功能,通过与TEMs的相关作用,发挥调节细胞迁移、黏附、融合、信号转导甚至转移的作用。有关家族成员TSPAN6的研究很少,其在胶质母细胞瘤(GBM)中的功能及相关机制尚不明确。本研究旨在通过基于癌症基因组图谱(TCGA)数据集的分析,从胶质瘤组织特异性表达、预后价值和信号通路富集等方面探讨其可能的作用,预测其在GBM中的功能,探讨其作为肿瘤治疗靶点的可能性。方法使用在线数据库分析工具GEPIA2、UALCAN与Oncolnc采集分析脑胶质瘤中TSPAN6的转录组表达谱及生存预后相关数据。从GEPIA2中分析得到TSPAN6基因的相似基因集,通过R studio对该基因集进行KEGG和GO功能富集分析。使用GEPIA2与R studio进行TSPAN6基因的转录组表达与促癌、增殖、迁移相关基因转录组表达的相关性分析。最后对703例胶质瘤患者的临床数据进行TSPAN6基因与预后因素的Cox单因素回归分析。结果与非肿瘤脑组织相比,TSPAN6的转录组表达在低级别胶质瘤(LGG)和胶质母细胞(GBM)中有明确升高(p<0.05);TSPAN6的转录组表达与胶质瘤患者的总体生存率的相关性具有统计学意义(p<0.05)。对TSPAN6相似基因集的功能富集分析结果显示,TSPAN6与纤毛、囊泡的形成、细胞运动等功能具有一定相关性,可能对胶质瘤的增殖、迁移、侵袭具有影响。分子间相关性分析结果显示,脑胶质瘤中TSPAN6基因与PCNA基因的转录组表达具有正相关性(P=0.039.R=0.16),与PTEN基因的表达水平具有负相关性(P=0.023、R=-0.18),与上皮间充质转化(EMT)过程中间质样细胞标志物Vimentin、α-SMA的表达量呈正相关性(均p<0.05,R=0.531、0.228)。结论TSPAN6的转录组表达在人脑胶质瘤比脑部非肿瘤组织中显著升高,与患者的总生存率(OS)具有相关性,且在肿瘤增殖、侵袭、迁移的过程中可能发挥作用,其表达可能对预测脑胶质瘤的发生、进展及预后具有一定价值。
其他文献
台风作为一种极端天气,是威胁沿海地区最为常见的自然灾害,每年直接或间接导致世界各国承受不可估量的经济损失甚至人员伤亡。其中台风对沿海电力系统的破坏更是直接致命的,严重影响着人们通讯、生产等方方面面。因此,对台风作用下配电网络的安全性评估进行研究具有重要意义。由于配电网输电杆大多为混凝土结构,且输电线路长期处在自然环境下,台风来临时容易发生断杆和倒杆等现象。因此,本文旨在对配电网在台风作用下的安全性
跨海悬索桥作为典型的跨海桥梁,是极其重要的交通枢纽,需要防止风险事故的发生,但是跨海悬索桥往往暴露于复杂的海洋环境中,时常出现大风天气,故风灾对于跨海悬索桥是一个非常重要的潜在风险,同时地震破坏性巨大,会对悬索桥产生巨大的威胁,因此为了防范这两种灾害对悬索桥的影响,避免造成巨大的经济损失和生命安全损失,在悬索桥运营期内对其在风灾和地震作用下的风险进行评估具有重要的意义。本文利用贝叶斯网络能够很好结
在能源价格高涨、电力供应紧缺的国际环境下,在中国“碳达峰、碳中和”的战略背景下,在“整县推进”等具体项目的规划下,提高屋顶太阳能光伏发电是能源消费结构转型的重要举措。然而,屋顶太阳能板容易受到风致破坏,工程师缺乏确定屋顶太阳能板的风荷载的参考,存在一定风险。围绕这一工程实际问题,通过风洞试验对不同布置形式、不同屋顶环境特性的高层建筑屋顶太阳能板风荷载进行了系统的探讨,基于风洞试验的结果,研究了光伏
目的:腹股沟疝气是小儿外科最常见的疾病,绝大部分患者需要手术治疗。手术创伤常会导致严重术后疼痛,严重者可影响患儿术后康复。骶管阻滞是下腹部手术常用的一种区域阻滞技术,具有良好镇痛效果,本实验拟探讨骶管阻滞在小儿腹腔镜疝气手术中的镇痛效果以及对术后相关并发症影响。方法:选取2020年1~10月我院院择期行腹股沟疝修补术患儿90例,ASAⅠⅡ级,男女不限,年龄1~8岁,采用随机数字表法,分为对照组(C
随着社会的发展和对建筑使用性能要求的提升,大跨屋盖结构因其内部空间充足、结构形式优美多变等优点得到广泛应用。但是,由于大跨屋盖结构的特点是质量轻、刚度小等,对于风的敏感性较高,在风荷载的作用下常常发生破坏事故。因此,深入研究大跨度屋盖结构的抗风性能对于实际的工程结构设计意义十分重大。本文基于大涡模拟方法通过数值模拟计算典型大跨屋盖结构表面的风荷载,对比风荷载作用下及等效静风荷载作用下结构的风致响应
目的探讨血清中细胞因子IL-15、IL-6、TNF-β、IFN-g、CRP及自噬标记蛋白Beclin1检测对早期肺腺癌的诊断价值,为临床早期诊断提供思路。方法选取2020年10月至2021年10月我院收治的早期肺腺癌患者45例及门诊健康志愿者45例。对拟选取标本的患者,进行病史采集,所有患者均空腹静脉采血5m L,分离血清,储存于洁净试管中置于-80℃储存备用。利用ELISA法对90例患者血清中I
随着社会经济的发展和土地资源的日益短缺,重载、复杂建筑及基础设施不断涌现,钢管混凝土结构结合了钢和混凝土两种材料的优势在重型承载结构中得到广泛应用。在长期承载的过程中,钢管混凝土柱中的混凝土受到荷载的持续作用将产生徐变,引起钢管和混凝土的内力重分布,使得结构体系各个组件的受力发生改变,影响结构性能。为提升和改善钢管混凝土柱的性能,可在钢管混凝土柱外套一层钢管,并在两层钢管间填充混凝土灌浆料,以加强
目的探究系统免疫炎症指数(SII)、中性粒细胞与淋巴细胞比值(NLR)对2型糖尿病(T2DM)患者发生颅内动脉狭窄(ICAS)的预测价值,并比较两者预测作用的优良性。方法收集2019年3月至2021年3月安徽医科大学附属阜阳人民医院神经内科收治的289例T2DM患者临床资料,根据计算机断层扫描血管造影(CTA)检查结果,将合并ICAS者分为血管狭窄组(ICAS组,176例),未合并ICAS者分为无
大跨度桥梁结构健康监测为在役桥梁安全、平稳地运行提供了有效的保障。作为桥梁健康监测领域的研究热点,实用的有限元模型修正技术和损伤识别方法对维护桥梁结构安全有重要工程意义。本文以汀九桥为工程背景,从大跨度桥梁结构精确有限元模型修正和斜拉索损伤识别两个角度出发,构建了利用精确有限元模型评估真实桥梁斜拉索状态的研究方法,为大跨度桥梁结构的有限元模型修正和损伤识别提供了指导。大跨度桥梁结构的模态特征对模型