在分子生物学中，基因调控的研究是一个非常重要的课题。近年来研究发现了一种重要的调控元件--microRNA(简写为miRNA)。miRNA通过抑制mRNA的翻译或者降解mRNA来调控基因，在人体中，超过30％的基因都受到miRNA的调控，被miRNA调控的基因称为靶基因。miRNA越来越受到人们的重视，准确的预测miRNA靶基因对理解基因转录调控机制有着很重要的作用。近年来的经典miRNA预测算法都是完全基于miRNA和mRNA的序列信息来进行预测，有很高的假阳性和不一致性，同时它们都不具备预测具有组织特异性及特定功能的靶基因。对此，我们提出了HCTarget算法，它综合了经典算法的优点，同时结合miRNA和mRNA在特定生物过程中的表达来进行miRNA靶基因的预测。我们通过结合TargetScan数据库的信息和骨髓瘤中的miRNA、mRNA表达信息来进行预测，得到了更加准确的预测结果。其中let-7的靶基因中2个被实验验证，miR-148中有8个被试验验证。而且我们的算法预测的靶基因具有疾病的特异性，结果中有3个基因被证明是和骨髓瘤相关的。