甘氨酸氧化酶的体外定向进化及F247饱和突变研究

来源 :华中农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:sunjuanhuahard
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
草甘膦是世界上广泛使用的一种广谱性除草剂,其通过干扰植物体内指导芳香族氨基酸合成的莽草酸途径而导致植物死亡,从而达到除草效果。然而,草甘膦在杀灭杂草的同时不可避免地对作物的正常生长造成影响,并导致作物体内草甘膦的积累,进而对生态环境和人类健康构成潜在危害。甘氨酸氧化酶(GO)能够氧化断裂草甘膦分子的C-N键使其降解,从而解除了其对作物生长的抑制作用,同时降低了其在作物体内的残留量。因此,开展草甘膦降解型基因的研究对农业生产、生态环境和人类健康具有重要意义。本研究利用DNA shuffling技术对蜡状芽孢杆菌甘氨酸氧化酶B3S1进行了体外定向进化改良,从10,000个突变体中筛选获得一株活性最高的突变体B4S7。利用纯化的蛋白进行酶学动力学常数研究发现,B4S7对草甘膦的Km=0.1 mM,kcat=3.62 min-1,kcat/Km=36.2 mM-1 min-1,与B3S1相比其对草甘膦的亲和性和催化效率分别提高了 4.3 倍和 0.6 倍;B4S7 对甘氨酸的 Km=50.34 mM,kcat=2.18 min-1,kcat/Km=0.04 mM-1 min-1,与B3S1相比其对甘氨酸的亲和性和催化效率均降低。B4S7的特异性常数(kcat/Km,草甘膦与kcat/Km,甘氨酸之比)为836,相比于B3S1提高了 3.9倍。同时,B4S7对草甘膦的值远小于已报道的其他GO。此外,对B4S7进行酶学性质研究发现,其最适反应温度(60℃)和最适反应pH(8.5)与B3S1相同,热稳定性和pH稳定性也与B3S1类似;Fe2+对B4S7活性具有十分明显的抑制作用,Ca2+、Ba2+、Sr2+对B4S7活性有明显的激活作用。对B4S7进行序列分析发现,其与B3S1相比发生了 4个氨基酸突变,分别为V198I,F247S,S307L和G357E。利用软件MOE对B4S7进行结构模拟及其与底物草甘膦的分子对接发现,F247S这一新颖的突变位点靠近酶的活性中心。为了探究该位点的作用,通过定点饱和突变将其余19种氨基酸引入该位点。酶学动力学研究结果表明,与B3S1相比,当247位点的苯丙氨酸突变为丝氨酸和精氨酸时,酶的特异性常数分别提高了 0.64倍和2.01倍;当苯丙氨酸突变为谷氨酸时,酶的特异性常数降低2.1倍;当苯丙氨酸突变为脯氨酸时,酶失去活性。因此,该位点在调节底物特异性方面发挥着重要作用。基于已知甘氨酸氧化酶的报道,结合结构模拟,选定B4S7的54位点进行定点突变,利用PCR介导的环状突变法将该位点的丙氨酸突变为精氨酸(A54R)。对突变体A54R进行酶学动力学常数测定发现,其对草甘膦的Km=0.049 mM,kcat/Km=61.02 mM-1 min-1,与B4S7和B3S1相比其对草甘膦的亲和性分别提高了 1.04倍和9.81倍,催化效率分别提高了 0.8倍和1.89倍;同时A54R对甘氨酸的亲和性和催化效率进一步降低。A54R的特异性常数为1907,比B4S7提高了 1.28倍,比B3S1提高了10.26倍,这说明A54R的底物特异性发生了进一步改变。本研究为甘氨酸氧化酶的改良及其结构与功能关系研究提供了新信息,同时为草甘膦抗性作物的发展提供了 一定的基础。
其他文献
犬巴贝斯虫病(Canine babesiosis)是由多种巴贝斯虫寄生于犬红细胞,从而引起犬只发病的一种发热性蜱传性疾病。犬感染这类血液寄生虫后主要表现为发热、面色苍白、黄疸、脾肿大、血管内外溶血、缺氧性损伤、全身炎症反应和血小板减少等。发病的严重程度很大程度上是由感染的巴贝斯虫的种或亚种决定的。目前临床诊断该病的方法主要是显微镜染色镜检,这个方法操作方便,但是对慢性感染犬和携带犬不能很好的检测出
学位
日本乙型脑炎(JE)是由日本乙型脑炎病毒(JEV)引起的自然疫源性疾病,多发于夏季,其发病特点主要为发热、畏寒、肌肉疼痛和精神错乱等,死亡率高达20-50%,而且患者痊愈后留下较高比例的神经系统后遗症(Bunai Y et al 2015)。目前JEV的治疗缺乏有效的方案,疫苗接种仍然是预防该病最主要的措施。探讨干扰素刺激基因(ISGs)对JEV增殖的影响对于开发研制JEV新型的治疗药物提供了新的
学位
2010年4月,鸭坦布苏病毒于在我国大部分养鸭地区流行,该病以蛋鸭产蛋量急速剧烈下降,雏鸭出现神经症状及死亡为特征,给养鸭业的发展造成了沉重的打击。鸭坦布苏病毒病的病原为鸭坦布苏病毒(Duck Tembusu virus,DTMUV),属于黄病毒科黄病毒属恩塔亚病毒群,为单股正链RNA病毒。作为流行不久的新发疫病,目前还没有足够有效的药物能及时治疗坦布苏病毒的感染,也没有商业化的疫苗投入广泛的临床
学位
由于矿产开采、金属冶炼和污水灌溉等导致了大量重金属在矿区周围土壤中积累。土壤中重金属的毒性不仅与其总量有关,还与其所处的赋存形态有关,因此,明确土壤重金属的形态也是评价其环境毒性、揭示其迁移和转化规律的重要基础。在现有的土壤重金属的形态分级方法中,对其交换态、碳酸盐结合态以及有机结合态都有较明确的界定,提取剂的针对性较强,铁氧化物结合态所用提取剂的选择性则存在某些问题和缺陷。用盐酸羟胺溶液或草酸-
学位
鸭病毒性肝炎是由3个不同血清型的鸭肝炎病毒引起的一种急性高度传染性疾病。2012年,国际命名委员会将血清Ⅰ型鸭肝炎病毒重新命名为小RNA病毒科禽肝病毒属的鸭甲肝病毒(DHAV)。血清I型鸭肝炎病毒(DHAV)是小RNA家族的成员,呈世界范围内流行。DHAV又分为三个基因型:DHAV-1、DHAV-2和DHAV-3。根据我国的流行病学调查,发现我国主要流行的毒株是DHAV-1和DHAV-3。近年来,
学位
光动力疗法(Photodynamic Therapy,PDT)是一种在癌症治疗方面具有广阔发展前景的医疗技术,其作用机制是激发态光敏剂(Photosensitizers,PSs)通过能量转移或电子转移生成具有细胞毒性的活性氧(Reactive Oxygen Species,ROS),与附近的生物大分子发生氧化反应从而杀死癌细胞。可激活光敏剂(Activatable Photosensitizers
学位
本文选取三种典型土壤矿物:针铁矿(Goe.)、蒙脱石(Mont.)和高岭石(Kao.)以及代表性有机磷农药:草甘膦(PMG)为研究对象,在考察三种矿物表面性质基础上,采用自动电位滴定、衰减全反射傅里叶变换红外光谱(ATR-FTIR)、等温滴定量热(ITC)等技术研究草甘膦在三种矿物界面的吸附行为,探讨p H、离子强度以及腐殖酸(HA)等因素对吸附过程的影响,初步阐明了草甘膦在三种矿物界面的吸附机制
学位
猪流感是由甲型流感病毒(IAV)引起猪的一种急性传染性呼吸系统疾病,通常只爆发于猪与猪之间。2009年发生新型猪流感大流行,对全球公众健康造成重大威胁,这种来源于猪的甲型流感病毒可感染人类,被认定为人畜共患的毒株。由于甲型流感病毒抗原性变异频繁,在疫苗免疫预防流感病毒感染方面存在一定的难度,因而发掘新型的抗流感病毒的药物显得尤为重要。干扰素诱导跨膜蛋白(interferon induced tra
学位
苏云金芽胞杆菌是一种产芽胞的革兰氏阳性菌,其主要特点是在芽胞形成过程中可以分泌由杀虫晶体蛋白组成的伴胞晶体,因而被广泛应用于害虫防治。聚-β-羟基丁酸(PHB)是细菌体内重要的碳源储藏物,PHB由乙酰辅酶A经β-酮硫解酶(P ha A)、乙酰乙酰辅酶A还原酶(Pha B)、PHB合成酶(Pha C)催化合成;PHB的分解则经PHB降解酶(Pha Z)、羟基丁酰辅酶A脱氢酶(Bdh A)、β-酮硫解
学位
我国每年会产生大量餐厨垃圾,传统的填埋、焚烧处理方式污染环境的同时会造成了大量资源浪费,添加腐熟剂堆肥处理餐厨垃圾已得到广泛应用,然而市售腐熟剂中耐高温菌较为缺乏,导致高温堆肥中腐熟微生物的生长受到抑制,另外堆肥过程中臭气释放影响到了工业化生产。本研究通过筛选耐高温降解菌,优化其发酵工艺,并应用到餐厨垃圾堆肥;另外研究添加脱臭菌剂对氨气释放及氮素保存的影响,为缩短堆肥周期,减少氮素损失及环境污染奠
学位