随着社会的高速发展,基层权力与分工都更加的具体化和专业化,各类社会问题也变得更加错综复杂,单一部门很难应对,必须通过多部门联合执法。目前,我国正处于大部制改革的关键时期,在新的行政体制下,实现政府部门的高效运转,健全跨部门的合作成为了改革的一项重要内容。且纵观国际上大部制改革的经验,改革实实在在地减少部门的数量,改善部门之间由于职能交叠不清,而相互推诿的状况,切实减少了行政资源浪费,提高政府部门的行政效率。然而大部制改革后产生新的部门边界,亦会产生新的政府间关系的矛盾;部门之间的执法关系协调问题被忽视,继而产生新的冲突,导致部门执法合作上问题频发。因此,本文在已有的研究基础上,从部门执法合作的基本理论出发,以A市B区牲畜屠宰管理执法为例,分析大部制改革前后部门执法合作的转变,并归纳概括出部门执法合作不足的表现,梳理大部制改革对各部门执法合作的状态的影响、对部门执法合作协调机制的影响、对部门执法合作主观意愿的影响。并结合影响部门执法合作的要素进行全面的成因分析,包括合作执法部门文化的缺失、合作执法部门利益博弈的权衡、中庸文化对合作执法理念影响三个内在因素方面,及执法合作部门设置局限性、合作执法协调机制不完善、部门改革的缺失三个外在因素方面进行分析。本文提出以下治理对策:一是科学整合、细化标准,明确执法部门职责体系。二是融合兼顾、统一标准,优化部门执法合作机制。三是统一规划,灵活模式,搭建信息共享平台。四是目标导向、打破边界,构筑执法合作执法文化体系。本文在公共管理理论框架下研究大部制改革后部门间的执法合作,在研究视角和研究方法上有所创新,研究结论丰富基层执法部门之间执法合作的理论指导和实践指南。