黑木耳[Auricularia auricula (L. ex Hook.) Underw.],是一种典型的胶质真菌,子实体质地柔软、富有弹性、食之口感甚佳、营养丰富,且兼具医疗价值。我国是人工栽培黑木耳最早的国家,也是世界上黑木耳种质资源最丰富的国家之一。生产量大但生产中使用的品种多为野生品种简单驯化而来的,对其遗传育种研究较少,产量和品质不稳定,这严重阻碍了黑木耳产业的持续发展。受“国家现代农业产业技术体系”专项经费的资助,本文对黑木耳不亲和性因子构成、菌株的评价与选择、杂交子鉴定方法和新品种选育进行了系统研究,旨在为黑木耳的遗传育种研究奠定基础,为黑木耳生产提供良种。具体试验结果如下：(1)不亲和性因子构成以单片5号为试验材料,光学显微镜和荧光显微镜镜检锁状联合的有、无确定来自单孢分离的单核菌株共22个,将这22个单核菌株利用三轮交配法,再通过连锁分析和卡平方测验,表明黑木耳由A、B两对不亲和性因子构成,四种交配型符合1：1：1：1的分离规律,从而明确了黑木耳为四极性食用菌。(2)亲本的评价与选择通过对35个黑木耳菌株的菌丝生长速度、生育期比较、商品性状和产量比较,筛选出优良亲本菌株结果如下：中农黄天菊花生育期较短；浙耳1号在40℃时菌丝生长速较快,朵型为菊花舒展型；延特3号朵型为单片簇生型；97-4在40℃时菌丝生长速较快,朵型为菊花紧凑型；东A1朵型为单片簇生型,产量较高为每百kg干料所生产出干耳的质量为7.12kg；海兰一号朵型为单片簇生型和细耳987在5℃时菌丝生长速较快,朵型为菊花紧凑型。(3)杂交子鉴定针对单、双核及杂交菌株真实性判断不准确的问题,本研究提出了一套科学系统的杂交菌株真实性鉴定方法：亲本子实体培育→孢子悬浊液配制→单孢分离→单核菌丝真实性鉴定(光学镜检初筛、双重荧光染色镜检精选)→杂交组合配制→杂交菌株真实性鉴定(拮抗试验初步鉴定生理特性与亲本异同、酯酶同工酶鉴定是否为亲本来源的真实杂交子)→进一步按照育种程序开展杂交品种选育研究(优良菌株菌丝培养特性、出菇特性、小试和区域试验、品种审定或认定)。(4)杂交新品种选育通过对22个杂交菌株小试和中试的菌丝生长速度、生育期比较、商品性状和产量比较选出1个性状优良的杂交菌株“远杂21”,该杂交菌株产量高,达到每百千克干料产干木耳7.5 kg,比亲本A4和A55产量超亲(中农黄天菊花和细耳987)8%以上,商品性状和品质较好,是一个具有开发潜力的优良菌株。