CircEMB_003抑制结直肠癌增殖和迁移的机制研究

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背景结直肠癌(colorectal cancer,CRC)是一种常见的消化道恶性肿瘤,其发病率及死亡率极高。因此,深入研究结直肠癌发生和演进的分子机制,寻找关键的分子标志物和药物靶点具有重要的科学意义及临床价值。环状RNA是近年来非编码RNA研究领域中的新星,其与肿瘤的发生发展关系密切。CircEMB_003(又名circ_0001481)是我们前期筛选出的一个抑制结直肠癌生长和迁移的候选环状RNA。本课题将深入探讨circ EMB_003在结直肠癌中的作用及其分子机制,以期为结直肠癌的研究提供新的理论基础。目的明确circ EMB_003在结直肠癌增殖和迁移中的作用;深入探讨circ EMB_003抑制结直肠癌增殖和迁移的具体分子机制,以期为研究结直肠癌发生和演进的分子机制提供新的理论基础。方法1、利用荧光原位分子杂交(Fluorescence in situ hybridization,FISH)检测circ EMB_003在结直肠癌组织中的表达情况。2、利用慢病毒感染方法构建circ EMB_003稳定干扰的结直肠癌细胞株,并利用RT-q PCR进行验证。3、利用CCK8细胞增殖实验和平板克隆形成实验检测circ EMB_003对结直肠癌细胞增殖的影响;利用Transwell细胞迁移实验和划痕愈合实验检测circ EMB_003对结直肠癌细胞迁移能力的影响。4、利用RNA pull-down联合质谱分析、生物信息学分析研究可能与circ EMB_003相互结合的蛋白PTBP3,并利用RNA结合蛋白免疫沉淀(RNA binding protein immunoprecipitation,RIP)方法进行验证。5、利用转录组测序及基因富集分析(Gene Set Enrichment Analysis,GSEA)方法探索circ EMB_003可能调控的信号通路PLD信号通路,并利用Western blotting及RT-q PCR方法进行验证。6、利用生物信息学分析PTBP3与PLD信号通路关键分子之间表达的相关性,同时利用Western blotting检测PTBP3对PLD信号通路关键分子表达的影响。结果1、利用荧光原位分子杂交实验证实circ EMB_003在CRC组织中表达下调,且主要定位于细胞质。2、构建circ EMB_003稳定干扰的结直肠癌细胞株SW480和RKO,同时采用RT-q PCR方法进行验证,结果显示稳定株构建成功。选择对circ EMB_003稳定干扰而对其线性母基因EMB无影响的干扰病毒用于后续实验。3、通过CCK8细胞增殖实验、平板克隆形成实验、Transwell细胞迁移实验和划痕愈合实验证实干扰circ EMB_003促进CRC细胞的体外增殖和迁移。4、RNA pull-down联合质谱分析、生物信息学分析及RIP实验证实circ EMB_003能够与PTBP3相结合。5、转录组测序、基因富集分析、Western blotting及RT-q PCR等实验证实circ EMB_003可调控PLD信号通路。6、生物信息学分析及Western blotting方法证实PTBP3能够调控PLD信号通路。结论CircEMB_003可能通过PTBP3调控PLD信号通路,进而抑制结直肠癌的增殖和迁移。
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