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人鼻病毒(human rhinOviruSeS,HRVs)是一种广泛分布且能引起人急性呼吸道疾病的主要致病源。人鼻病毒分为A种,B种和近年来新发现的C种。为了研究在中国上海地区,人鼻病毒的分布和致病性情况,我们开展了为期两年的急性呼吸道感染患儿样本收集和鉴定工作。本实验中,共收集患儿鼻咽拭子样本827例,通过扩增HRV P1-VP2大约924bps(HRV16-163-1086bp)的序列并测序,我们得到了HRV阳性样本64例共66个HRVs(一例HRV-A和HRV-B共感染,一例HRV-A和HRV-C共感染)并分别绘制VP4/VP2,P1P2进化树来分类人鼻病毒。通过分析比较VP4/VP2序列,34个HRV(51.5%)属于近年来新发现的C种,但是当我们分析P1P2(5’UTR)这个区域时,20个在VP4/VP2区域属于C种的HRVs,却分布在A种区。因此我们推断在5’UTR和VP4/VP2的结合处出现了HRV-A和HRV-C的种间重组,并建议同行们以此把C种划分为两种不同的HRV-C,HRV-Ca和HRV-Cc,为了进一步检验鼻病毒全长中是否出现其它位点重组,我们在样本中抽取一个HRV-A(N13),一个HRV-Cc(N10),一个HRV-Ca(N4)进行全长测序。通过全长序列的分析发现,N4在非结构蛋白编码区2A,3D和非编码区5’UTR,3’UTR都出现了重组。
结论:我们的研究结果表明,在上海地区,大量高变异性的HRV-C可以在患有急性呼吸道感染的患儿体内检测出来,而且在样本中发现不同人鼻病毒之间出现了种间和种内的重组。我们的病例显示,人鼻病毒HRV-C相对于HRV-A和HRV-B,在致病性方面没有显著差异。