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缺乏合适的动物模型是制约艾滋病研究取得重大突破的关键瓶颈之一。细胞内的抗病毒蛋白被称为限制因子。研究不同灵长类动物抗HIV-1宿主限制因子的存在形式及作用机制对建立合适的AIDS灵长类动物模型有十分重要的意义。TRIM5α是哺乳动物细胞中一种重要和关键的限制因子,它以物种依赖的方式限制包括HW-l在内的逆转录病毒的感染。TRIM5-CypA融合基因是存在于新大陆猴与旧大陆猴中的一种独特的TRIM5基因形式。
为了研究不同灵长类动物TRIM5基因的存在方式,本文对熊猴、藏酋猴、红面猴及中国恒河猴4个物种共110只灵长类动物进行了TRIM5-CypA融合模式的研究。首次发现熊猴也存在TRIM5-CypA基因融合现象。熊猴TRIM5-CypA融合基因形成模式类似于北平顶猴TRIMCyp融合基因模式,即CypA假基因的cDNA序列通过逆转座方式插入到TRIM5基因的3-UTR区域。基因序列分析表明,该基因与北平顶猴相应基因序列高度相似;并且其TRIM5内含子6的3’-剪接位点也相应存在G-to-T突变现象(G/T),。通过RT-PCR对熊猴TRIM5-CypA融合基因的转录本进行分析,我们鉴定出熊猴TRIMCyp融合基因共有4种不同的选择性剪接产物,将它们分别命名为asmTRIMCypV1-V4。克隆丰度和序列分析结果显示,asmTRIMCypV2是优势剪接体并可能在该融合基因产物的功能中发挥作用。研究发现熊猴TRIMCyp融合基因主要转录本中外显子7和8均被剪切丢失。外显子7剪切丢失机制源于TRIM5内含子6中3’-剪接位点的G-to-T突变。氨基酸序列比对显示,熊猴TRIMCyp融合蛋白CypA结构域中与逆转录病毒限制活性相关的氨基酸位点突变与食蟹猴TRIMCyp的CypA结构域中相应位点的突变情况相同。提示熊猴TRIMCyp可能具有与食蟹猴TRIMCyp相似的抗逆转录病毒活性。