近些年，随着茶饮料工业越来越壮大，茶饮料的食品安全也越来越受重视，其中很重要的一部分就是微生物的污染，不仅会给企业带来巨大的损失，也会给消费者带来危害。本课题是对企业茶饮料生产线上包装材料、原辅料、水和空气进行全面采集培养，共采集394个样品，依据国家标准对细菌和真菌进行菌总数统计，发现夏冬季节细菌污染相对突出，而春秋季节真菌污染较严重；总体看，数量上细菌比真菌多，重要原料-茶叶微生物污染比较严重。对优势菌株采用分子生物学方法结合传统方法进行鉴定，用到的主要技术有核糖体RNA编码16SrDNA序列分析（细菌）、核糖体RNA编码18SrDNA序列分析（酵母），以及16SrDNA序列分析结合RNA聚合酶β亚基编码的rpoB基因分析（肠杆菌科细菌）以及传统的生理生化测试和显微观察的鉴定方法，运用这些技术，对其进行鉴定和特性分析，对潜在危害较大（各种食源性致病菌），如阪崎肠杆菌，以及检出率较高或具有特殊性质污染菌进行重点分析。本课题主要是对茶饮料生产线做一个背景调查，以帮助企业预防微生物污染及其在实际案例中通过了解污染微生物的特征，快速排查污染源及污染途径，采取及时有效地解决措施，为预防微生物污染问题提供科学依据。