流域作为一个特殊区域,因其复杂环境特性以及与行政区的矛盾关系,造成了流域综合开发和建设中各相关利益主体间的矛盾和冲突,影响了区域的协调发展。所以建立起相应的流域生态补偿机制,通过生态受益者对生态建设者的合理补偿,生态破坏者对受损者的合理赔偿,对实现生态利益在地区间的合理分配具有一定的现实意义。　　 本文在综合比较国内外流域生态补偿实践的基础上,结合我国的制度特点和流域环境特性,提出科层制模式和准市场机制模式是我国现阶段具备可行性的补偿模式,其中科层制模式因其依靠上级政府完全的行政命令,在大型流域的生态治理中具有直接和简单的特点,但是面对中小流域的治理问题时,出现了低效率等问题,准市场机制由于融合了政府和市场的特点,在解决跨市不跨省的中小流域生态补偿问题时,能够克服完全政府和完全市场的缺点,是一种更具普遍适用性的补偿模式。本文选择以闽江流域为中小流域的代表,分析了该流域的准市场模式,包括对政府间的博弈关系的分析,以及根据下游用水居民的最大支付意愿推算出闽江流域下游居民对上游补偿的标准,最后从立法、资金筹集、资金使用、区域经济合作等角度提出完善流域生态补偿准市场机制的办法。