猪4个候选基因SNP检测及与饲料转化效率性状的关联性分析

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猪肉一直是我国主要的肉类食品来源,我国对养猪业十分地重视,猪肉产量以及生猪存栏数保持逐年增长的势头。如何提高饲料转化效率,降低生产成本,扩大养殖规模,实现集约化养殖一直是困扰养猪企业和养殖户的难题。随着生命科学技术的发展,生猪的抗病力和生产效益得到显著提高。但是饲料转化效率远未能达到人们的期望。  个体种类、环境和应激效应、饲料因素以及能量代谢对猪群的饲料转化效率都有不同的影响。本研究基于一个美系纯种大白资源群体建立、对猪群生产性状的测定,结合分子生物学、生物统计学以及群体遗传学等方法对 Resistin、Orexin、CTNNB1、MC4R基因进行了SNP检测及与平均日增重、采食量、预测采食量、饲料转化率、肌内脂肪等性状的关联分析。同时通过Real-Time PCR技术验证了数字基因表达谱测序技术(DGE)筛选的高、低剩余采食量差异表达基因,取得如下结果:  (1)建立了一个有286头美系纯种大白资源群体,该群体有完整的生产性状和疾病记录等表型记录,提取了基因组DNA和RNA。  (2)在猪Resistin基因第974位点发现T>C多态位点。TT基因型个体平均日增重大于CC基因型个体,且差异显著(P<0.05)。  (3)在猪Orexin基因第516位点发现G>A多态位点,此位点与平均日增重、采食量极显著相关(P<0.01),与预测采食量、剩余采食量显著相关(P<0.05)。GG、GA型个体采食量大于AA型个体,且差异极显著(P<0.01);GG型个体预测采食量大于AA型个体,且差异极显著,GA型个体预测采食量大于AA型个体,且差异显著;GG型个体剩余采食量大于AA型个体,且差异显著(P<0.05),GA型个体剩余采食量大于AA型个体,且差异极显著(P<0.01)。  (4)在猪CTNNB1基因第136520位点发现C>G多态位点及第39464位点发现A>G多态位点。而A>G位点没有产生内切酶位点,C>G位点与性状均不显著相关,不同基因型间无显著差异(P>0.05)。  (5)在MC4R第1426位点发现G>A多态位点,此位点与性状均不显著相关,不同基因型间无显著差异(P>0.05)。  (6)在DGE筛选结果中随机筛选7个基因,通过Real-Time PCR方法验证高、低组差异表达基因,结果表明验证基因表达趋势同DGE筛选结果一致,且有5个基因在高、低RFI组中差异性显著(P<0.05)。
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