【摘 要】
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黄鳝具有天然的性逆转过程和较小的基因组,这些特征使其成为比较理想的研究性别分化的脊椎动物模型。Orphan基因是每个物种特有的基因,对物种进化和特殊的适应性具有重要作用。本研究从黄鳝转录组数据中对orphan基因进行筛选,利用BLAST在线比对工具,将黄鳝全部蛋白数据与现有已知物种蛋白序列进行比对,得到1533个在黄鳝物种中特异存在的基因,即黄鳝的orphan基因,约占总基因个数的8%。对orph
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黄鳝具有天然的性逆转过程和较小的基因组,这些特征使其成为比较理想的研究性别分化的脊椎动物模型。Orphan基因是每个物种特有的基因,对物种进化和特殊的适应性具有重要作用。本研究从黄鳝转录组数据中对orphan基因进行筛选,利用BLAST在线比对工具,将黄鳝全部蛋白数据与现有已知物种蛋白序列进行比对,得到1533个在黄鳝物种中特异存在的基因,即黄鳝的orphan基因,约占总基因个数的8%。对orphan基因在黄鳝染色体上的分布进行统计和分析,结果表明7号和10号染色体orphan基因密度偏高,显示存在一定的染色体偏好性。用转录组数据分析orphan基因在黄鳝卵巢、卵睾体、精巢三种性腺组织的表达模式,在精巢中表达的基因数最多,且多数基因在精巢中的表达量比卵睾体和卵巢高,提示其在雄性分化的偏好性作用。通过RT-PCR分析黄鳝164个orphan基因在成体组织的表达模式,其中15个性腺组织特异性表达基因,32个广谱表达,58个非广谱且在脑组织表达,59个非性腺特异性表达且不在脑组织中表达。分析orphan基因在成体性腺组织表达,精巢高表达基因72个,卵睾体高表达基因11个,卵巢高表达基因9个。Orphan基因的组织表达模式具有多样性,但具有雄性偏好性。本研究对黄鳝orphan基因的表达产物在细胞中的定位进行了实验分析,从测序正确的基因中随机挑选15个基因,将其构建到EGFP-C1绿色荧光融合蛋白表达载体上,通过脂质体介导转染法将orphan基因导入He La细胞。结果显示,表达产物在细胞核和质均有分布的orphan基因有10个,只在细胞核分布的orphan基因有3个,只在细胞质中分布的orphan基因有2个。Orphan基因表达产物在细胞中的分布与基因功能有着密切的关系,为基因功能的研究奠定了基础。找出可能在黄鳝性逆转过程中发挥重要作用的关键基因,将为性逆转分子机制探索提供信息。通过筛选得到基因MONAL-011480,为精巢高表达基因。对此基因进行蛋白结构预测和进化分析。同时制备多克隆抗体,在蛋白水平上分析此基因的成体组织表达模式,确定了该基因表达的蛋白主要在精巢中高表达,说明该基因在雄性的分化中可能具有一定生物学功能。
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