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目的：县级中医医院作为农村中医医疗卫生服务网络的“龙头”，肩负着保障人民健康和继承、发展中医药事业的重要责任。县级中医医院作为深化医药卫生体制改革中的关键一环，其经济运营水平和发展，直接影响基层医疗服务网络体系的完善，中医医疗技术的继承和创新。近年来，国家加大对中医药事业的政策支持和资金投入，研究2009-2014年广西县级中医医院的投入产出效率，分析影响广西县级中医医院效率变化的因素，对于提升广西县级中医医院的服务能力、健全广西中医药壮瑶医药服务体系、积极推进分级诊疗制度、满足广西人民群众健康服务的需求具有重要意义。 方法：本研究采用描述性统计的方法，对比广西全区、全国的中医服务水平，对2009-2014年广西县级中医医院在人力资源、物力资源、医院工作效率、医院收入与支出四个方面的投入和产出现状进行分析。通过文献研究法、相关系数法、聚类分析法、变异系数法确定了DEA分析的投入产出指标，运用DEA-Malmquist模型分析了广西县级中医医院投入产出效率的动态变化趋势，运用DEA-CCR模型对投入产出指标进行了投影分析。通过Tobit模型分析影响广西县级中医医院投入产出效率变化的因素。 结果：(1)投入产出现状结果：中医执业（助理）医师数占执业（助理）医师总人数比2009年为46.154％、2014年为50.785％，中医药人才数量在逐年增长。院均每万人口卫生技术人员数2009年为2.591人，2014年为4.593人，年均增长12.127％。广西县级中医医院院均每万人口床位数2009年为2.232张，低于广西全区中医医院院均2.415张、全国中医医院院均2.705张;2014年增长到4.195张，低于广西全区中医医院院均4.512张、全国中医医院院均4.597张。医生日均负担诊疗人次2009年为6.477人次、2014年为5.518人次。药品收入占医疗收入比2009年为40.054％、2014年为34.934％。住院人次均医药费2009年为2355.592元，2014年为3838.027元，年均增长10.256％。医院负债率2009年为39.632％、2014年为46.579％，均高于30％。(2)投入产出效率分析结果：2009-2014年，全要素生产率变动均呈下降趋势。全要素生产率变动(TFP)呈上升趋势的医院有3家，占60家医院总数的2％，98％的医院全要素生产率变动呈下降趋势。非DEA有效医院的投入指标原始值均呈过剩状态，产出指标中的门急诊人次数、出院人数的原始值离目标值还存在一定的差距。(3)影响因素的Tobit回归结果：县人均生产总值、出院人数占广西县中医医院出院人数比、中药师（士）数占医院药师（士）总数比、药品收入的P值在0.001水平上显著，对医院效率影响力度较大。 结论：通过对广西县级中医医院的投入产出现状、医院效率、及影响医院效率变化的因素进行分析得知：医院资源储备不足，经济运营能力不够高;医院投入产出整体效率不高，个体效率发展水平不齐;医院发展受区域社会发展水平、经济发展水平、公益性水平、医院外部环境、医院自身条件五方面的多重影响。对此，我们应：(1)大力发展县域经济，提高人民中医医疗服务支付能力。(2)建立区域卫生规划，统筹优化县域卫生资源。(3)增加政府财政投入，保障医院公益性。(4)加强用人机制，提高专业技术水平，突出中医药壮瑶医药服务优势。(5)建立健全投入产出和绩效管理机制，提高经济运营效率。