水貂是我国部分地区饲养的主要特种经济动物，水貂的产仔数是一个重要的经济性状，产仔数的提高将大大增加水貂年存栏量，给养貂业带来巨大的经济效益。因此，有效地提高水貂的产仔数是水貂育种的主要目标之一。运用现代分子生物学技术来研究这一品种产仔性状的分子遗传机制，对水貂的品种选育工作具有十分重要的意义。本研究选择ESR、FSHβ、FSHR、PRLR四个基因作为候选基因，采用克隆测序结合PCR-SSCP的方法，检测了这些基因的部分编码区的SNPs，并分析了突变位点导致的多态性与产仔数和产活仔数之间的相关性。随着水貂饲养业的大力发展，一些彩色水貂品种相继出现，但关于彩色水貂与标准黑褐色水貂之间遗传关系的研究，至今无人报道。为了揭示水貂品种内和品种间的遗传关系，本研究采集了标准黑褐色水貂、蓝宝石貂、咖啡色貂3个品种的89个样本，应用RAMP标记对这3个品种的遗传结构进行了分析。本论文主要研究结果如下：(1)分别检测了ESR基因外显子1和外显子7。在外显子1处发现了一个突变位点产生了3种基因型，突变位点为G256C，该突变导致编码氨基酸甘氨酸到丙氨酸的改变，属于错义突变。在ESR基因外显子7处检测到2种基因型。(2)在ESR基因外显子1上，在所检测的水貂群体中，A等位基因有利于母貂的产仔数。在ESR基因外显子7处，检测到的2种基因型对产仔数和产活仔数的影响差异都不显著。(3)对FSHβ基因外显子3的检测表明，该处存在一个突变位点，即C75T，该突变导致编码氨基酸脯氨酸到亮氨酸的改变，C75T突变导致的三种基因型对产仔数性状的影响接近显著水平(P=0.0516)。(4)在FSHR基因外显子10处检测到一个突变位点A741C，这一突变并未导致编码氨基酸的改变。这一突变产生的三种基因型对水貂产活仔数的影响有显著的趋势。(5)在PRLR基因的外显子2和外显子10处，并未检测到SSCP多态性。(6)在RAMP标记分析中，从240个引物组合中筛选出14个引物组合对标准黑褐色水貂、蓝宝石貂、咖啡色貂3个品种的89个样本进行了扩增。共扩增出81条DNA片段，75条具有多态性，多态百分率为92.59％，每个引物组合可扩增4～8条多态性条带，平均5.78条。遗传相似系数变化范围为0.3469～0.9796，平均值为0.610。聚类分析显示，RAMP标记能将供试材料区分开。多态条带比率、Shannon多样性指数以及Nei基因多样性指数(h)均显示水貂与彩貂品种间较为丰富的遗传多样性。采用Nei遗传距离、Shannon多样性指数、Gst基因分化系数等方法对3个群体进行居群分析，结果表明水貂与彩貂品种间遗传分化程度不高，遗传变异主要来自种群内。