肝癌分子标志物circRNA初探

来源 :河北医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zlzlzl567
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
第一部分四种circRNA在肝组织中的表达水平及对肝癌的诊断价值目的:检测hsa_circRNA_404974、hsa_circRNA_001387、hsa_circRNA_100246和hsa_circRNA_091581四种circRNA在肝癌患者癌组织及其癌旁组织中表达量,分析在肝癌组织及其癌旁中存在差异表达的circRNA在肝癌组织中的表达量与肝癌患者临床基本信息的关系,并探讨哪种circRNA可以作为肝癌分子诊断标志物。方法:1.应用q RT-PCR技术,分析55对肝癌患者癌组织及其癌旁组织中hsa_circRNA_404974、hsa_circRNA_001387、hsa_circRNA_100246和hsa_circRNA_091581的相对表达量。2.分析在肝癌组织及其癌旁组织中有差异表达circRNA的表达量与肝癌患者临床资料的关系。3.根据circRNA在肝组织中的表达量,应用ROC曲线分析其是否可以作为肝癌分子诊断标志物。4.本文数据采用SPSS21.0软件进行统计学分析,circRNA在肝癌患者癌组织和配对的癌旁组织的差异表达,应用符号秩和检验进行显著性分析;circRNA在癌组织中的表达量与临床资料的分析,应用Wilcoxon秩和检验;诊断试验应用ROC曲线进行分析。结果:1.q RT-PCR方法检测四种circRNA在55例肝癌患者癌组织和癌旁组织的结果表明,hsa_circRNA_404974在肝癌患者癌组织中的表达量显著低于其癌旁组织(P<0.001);hsa_circRNA_001387在肝癌患者癌组织中的表达量显著高于其癌旁组织(P<0.001);hsa_circRNA_100246在肝癌患者癌组织中的表达量显著低于其癌旁组织(P<0.001);hsa_circRNA_091581在肝癌组织和配对的癌旁组织中的表达量无统计学差异(P>0.05)。2.患者癌组织中circRNA的表达量与患者临床基本信息分析显示:hsa_circRNA_404974在肝癌组织中的表达量与患者肝内肿瘤个数及瘤旁子灶有关(均P<0.05);hsa_circRNA_001387在肝癌组织的表达量与患者AFP水平有关(P<0.05);hsa_circRNA_100246在肝癌组织的表达量也与患者AFP水平有关(P<0.05)。3.根据circRNA在肝组织中的表达量绘制ROC曲线,hsa_circRNA_404974结果显示,ROC曲线下面积为0.896,P<0.001,95%可信区间为(0.828,0.964),灵敏度为83.64%,特异度为90.91%,准确度为87.27%;hsa_circRNA_001387结果显示,ROC曲线下面积为0.884,P<0.001,95%可信区间为(0.816,0.952),灵敏度为80.00%,特异度为90.91%,准确度为85.45%;hsa_circRNA_100246结果显示,ROC曲线下面积为0.714,P<0.001,95%可信区间为(0.619,0.809),灵敏度为81.82%,特异度为54.55%,准确度为68.18%;联合诊断试验结果显示,ROC曲线下面积为0.953,P<0.001,95%可信区间为(0.912,0.994),灵敏度为90.91%,特异度为90.91%。结论:1.hsa_circRNA_404974在肝癌组织中低表达,与患者肝内肿瘤个数和瘤旁子灶有关,可能参与肝癌的发生发展,以hsa_circRNA_404974作为肝癌分子标志物,诊断价值较好。2.hsa_circRNA_001387在肝癌组织中高表达,与患者AFP水平有关,可能参与肝癌的发生发展,以hsa_circRNA_001387作为肝癌分子标志物,诊断价值较好。3.hsa_circRNA_100246在肝癌组织中低表达,与患者AFP水平有关,可能参与肝癌发生发展,但以hsa_circRNA_100246作为肝癌分子标志物,诊断价值较差。4.hsa_circRNA_091581在肝癌组织中的表达水平和配对癌旁组织中的表达水平无统计学意义,可能没有参与肝癌的发生发展。第二部分hsa_circRNA_404974的稳定过表达对肝癌细胞功能影响目的:构建hsa_circRNA_404974稳定过表达细胞,探索其对肝癌细胞系增殖、迁移和侵袭功能的影响。方法:1.应用细胞单克隆培养技术构建hsa_circRNA_404974稳定过表达的肝癌细胞克隆。2.应用CCK8实验分析hsa_circRNA_404974在肝癌细胞系中过表达对细胞增殖功能的影响。3.应用克隆形成实验分析hsa_circRNA_404974在肝癌细胞系中过表达对细胞增殖功能的影响。4.应用Transwell迁移实验分析hsa_circRNA_404974在肝癌细胞系中过表达对细胞迁移功能的影响。5.应用Transwell侵袭实验分析hsa_circRNA_404974在肝癌细胞系中过表达对细胞侵袭功能的影响。结果:1.应用q RT-PCR技术对克隆重组细胞进行两次筛选,从QGY-7703和Huh-7两种肝癌细胞系中各筛选出两株hsa_circRNA_404974稳定过表达细胞克隆和一株阴性对照(nc)细胞克隆,即QGY-7703肝癌细胞的克隆(clone)3、clone15和nc,Huh-7肝癌细胞的clone5、clone6和nc。这6株肝癌细胞克隆,被用于后续的细胞功能实验研究。2.hsa_circRNA_404974过表达的肝癌细胞CCK8实验结果显示:在肝癌细胞系QGY-7703中,细胞培养48h和72h后clone3和clone15与nc的吸光度值(Optical density,OD)比较,均无统计学差异(P>0.05);在肝癌细胞系Huh-7中,细胞培养0h、24h、48h和72h后clone5和clone6与nc的OD值比较,均无统计学差异(P>0.05)。3.hsa_circRNA_404974过表达的肝癌细胞克隆形成实验结果显示:在肝癌细胞系QGY-7703中,clone3和clone15的克隆形成数与nc比较均无统计学意义(P>0.05);在肝癌细胞系Huh-7中,clone5和clone6的克隆形成数与nc比较均无统计学意义(P>0.05)。4.hsa_circRNA_404974过表达的肝癌细胞Transwell迁移实验结果显示:在肝癌细胞系QGY-7703中,clone3和clone15穿过Transwell小室基底膜的细胞数量显著少于nc(均P<0.05);在肝癌细胞系Huh-7中,clone5和clone6穿过Transwell小室基底膜的细胞数量也显著少于nc(均P<0.05)。5.hsa_circRNA_404974过表达的肝癌细胞Transwell侵袭实验结果显示:在肝癌细胞系QGY-7703中,clone3和clone15穿过Transwell小室基质胶的细胞数量显著少于nc(P<0.05);在肝癌细胞系Huh-7中,clone5和clone6穿过Transwell小室基质胶的细胞数量也显著少于nc(P<0.05)。结论:1.通过药物筛选细胞,成功构建hsa_circRNA_404974在QGY-7703和Huh-7两种肝癌细胞系稳定过表达细胞株。2.hsa_circRNA_404974的过表达对细胞增殖能力未产生影响,但能抑制细胞的迁移和侵袭能力,可能参与肿瘤的转移。
其他文献
热连轧机在轧制过程中产生的异常振动严重制约着板材的质量,然而单一方向的振动研究,并不能很好的表达出振动产生的影响。因此将不同方向的振动在同一模型表达出来,并且在连续轧制中分析轧机振动的情况尤为关键。就热连轧机垂直-水平耦合振动本文主要研究的内容有:(1)以某钢厂1580轧机为研究对象,在已有的热轧机工作机座三维有限元模型的基础上,利用有限元软件提取相应各个零部件之间的垂直刚度,详细阐述了具体步骤,
语言与文化相互依存、彼此影响、密不可分。一直以来人们对语言与文化的关系各抒己见,但总的来说,语言包含于文化,是文化的载体,受文化的制约。语言中有一类富含文化背景意义
张枣是新时期以来重要的诗人,著名的“巴蜀五君”之一。声音是他诗歌创作中的一个重要出发点,他的作品对诗歌声音精密、灵活的控制一直为人称道。本文从声音的形式安排、声音
本研究采用完全随机设计方法,选择体重相近(417.7±30.83)kg、健康的淘汰母牛40头,随机分为4组,每组10头。对照组饲喂基础日粮,试验组分别在基础日粮上添加0.5%CLA、1.0%CLA
随着国内燃气——蒸汽联合循环发电厂的兴起,电厂核心设备的燃气轮机和联合循环汽轮机的市场需求随之增加。由于燃气电厂对天然气供给的时间及价格因素的极度敏感,所以市场对
化石能源的大量使用给环境带来了严重的负面影响,开发清洁能源已经迫在眉睫。太阳能作为一种取之不尽用之不竭的清洁能源具有广阔的发展前景。迄今为止,太阳能电池的发展经历
商业化的肌电假肢能够帮助上肢截肢者重建部分运动功能,从而显著提高假肢使用者对物体的操控能力。目前的人工假肢已经达到了较高的控制水平,但是感觉反馈功能的缺失仍然使得
蓝莓(Blueberry)是杜鹃花科(Ericaceae)越橘属(Vaccinium)植物,蔓越莓(Cranberry)为其近缘种,两者因果实营养丰富而被广泛种植。蓝莓种苗混杂问题日益突出,因此亟需开发准确且有效的
第一部分MRI-T2 FLAIR高信号血管征对急性大脑中动脉供血区脑梗塞的诊断价值目的:研究大脑中动脉供血区急性脑梗塞患者在T2-FLAIR上高信号血管征(hyperintense vessel signal
高度近视一般是指近视度超过-6.00D的近视,其屈光度进行性加深,眼球矢状轴不断延长,会导致一系列眼底并发症出现[1-2],例如:后巩膜葡萄肿、视盘周围萎缩弧、豹纹状改变、漆裂