农产品全程质量安全监管是一项复杂的社会经济系统工程,运用大系统控制论的方法,按照农产品质量安全监管的总目标要求以及其相关环境,从农产品生产端的供给侧开展研究,期望通过梳理农产品质量安全监管机构及其职责,设计良好的协调机制,并提出农产品生产经营主体保障食品安全的行为规范措施,其研究成果可供政府决策部门的宏观调控和科学决策提供参考作用,也为农业企业等农产品生产者规范生产经营行为提出指导依据。农产品全程质量安全监管体系是一个复杂的大系统,由许多子系统构成,因此,运用大系统控制理论来研究农产品质量安全监管具有科学依据和现实意义。通过生产经营主体与政府监管的农产品质量安全博弈行为分析,认为完善法律法规和监管体制机制是保障农产品质量安全的关键所在。通过728个农产品质量安全事件的判别与定位矩阵模型分析,认为影响农产品质量安全因素依次是化学性污染、生物性污染、环境污染和假冒伪劣,农产品生产经营者素质与能力水平制约着农产品质量安全水平的提高。通过农产品质量安全生产的个案分析,认为农产品质量安全水平受农业投入品、农业生产者和政府监管的制约。为此,本文从多级递阶控制系统、多层递阶控制系统和多段递阶控制系统三个方面提出纵向监管结构延伸、横向监管结构缩减、抓住监管关键点等具体政策建议。