铁死亡通路中的MicroRNA调控网络

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目的:通过文献调研分析,结合铁死亡通路找到关键调控基因,利用生物信息学分析可调控这些关键基因3′UTR区的MicroRNA(miRNA)分子,分别在铁死亡敏感的A549和He La细胞系中研究miRNA对于铁死亡的影响,根据结果绘制铁死亡的MicroRNA调控网络,进一步验证调控网络的可信度,明确miRNA与铁死亡的相关性。方法:查阅文献,结合铁死亡通路分析得到对于铁死亡发生发展过程中具有调控作用的基因,针对基因的3′UTR区设计引物序列,通过PCR扩增得到3′UTR区并将其构建到荧光素酶报告基因载体PGL-3M中。借助生物信息学分析网站Targetscan查询得到与关键基因3′UTR区可能存在作用的miRNA,从实验室保存的miRNA表达文库中扩增出所需要的表达载体,在HEK-293T细胞系中运用双荧光素酶报告基因实验分析miRNA对铁死亡关键调控基因3′UTR的调控作用,初步筛选获得对铁死亡关键基因具有调控作用的miRNA,分别在A549细胞系以及He La细胞系中通过jet PRIME?试剂转染进行过表达,在铁死亡诱导剂RSL3的作用下,利用流式细胞仪检测在铁死亡发生时,miRNA对于铁死亡关键指标指标脂质过氧化的影响,结合实验结果分析总结在A549以及He La细胞系中miRNA对于其靶向基因的调控网络。对得到的调控网络进行验证,利用q RT-PCR和Western blot检测miRNA具体调控的基因,同时检测铁死亡发生时,MicroRNA对于MDA以及细胞活力的影响,深入验证miRNA对铁死亡的调控作用,探究miRNA在铁死亡信号通路中发挥作用的机制。结果:1、通过文献调研分析得到在铁死亡通路的12个关键调控基因,并成功构建出12个调控基因的报告基因载体。2、通过Targetscan网站预测可能与每个基因3′UTR区存在作用的miRNA,从实验室已有miRNA表达文库中成功扩增出预测的miRNA。3、双荧光素酶报告基因实验筛选得到对关键基因3′UTR区产生作用的42个miRNA。4、在A549以及He La细胞系中分别验证了过表达miRNA的作用,通过流式细胞仪检测脂质过氧化水平的变化,得到了在A549细胞系中起作用的12个miRNA,在He La细胞系中起作用的11个miRNA,结合miRNA靶向的基因,分别在A549以及He La细胞系中得到miRNA对于铁死亡关键基因的调控网络图。5、对A549细胞调控网络中的mi R-9以及He La细胞调控网络的mi R-195进行了深入研究,结果显示mi R-9通过靶向GCH1基因在A549细胞中产生了促进铁死亡的作用,mi R-195通过靶向ACSL4在He La细胞中产生了抑制铁死亡的作用。结论:在铁死亡信号通路中,miRNA可以通过调控关键基因的表达进而对铁死亡的发生发展产生作用,在不同的细胞系中,miRNA发挥作用的方式不同,由此所带来的结果也不一样,说明miRNA对铁死亡的调控异常复杂,这些结果也为研究铁死亡提供了新的思路。
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