谷子中与顶端优势相关基因PF40的克隆及功能研究

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以谷子授粉后5d、7d和12d的未成熟种子为材料,提取总RNA并富集mRNA,构建了谷子未成熟种子的cDNA表达文库,文库容量为2×10<7>pfu/ml.采用SB401原核表达蛋白质制备抗血清,利用抗原-抗体反应筛选cDNA表达文库.对筛选得到的6个阳性克隆PF11、PF14、PF17、PF40、PF52进行序列测定、GenBank+EMBL+DDBL数据库同源序列查询,结果PF11与脂转移蛋白基因同源性为72﹪,PF14与半胱氨酸合成酶基因同源性为78﹪,PF17与过氧化物酶基因同源性为81﹪,PF27与20S蛋白酶体PAC1基因同源性为83﹪,PF40与拟南芥中功能未知的AT3g20870/MOE17-16 mRNA同源性为51﹪,PF52未发现同源基因.对PF40基因进行进一步研究.PF40基因由1274个核苷酸组成,推测其编码的蛋白质含有277个氨基酸,分子量为29445Da.生物学软件分析结果表明,PF40蛋白的疏水区域占优势,肽链上有多个可以被磷酸化、烷基化修饰的位点.这些特点可能为PF40蛋白发挥其生理功能提供结构基础.
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