供应链是由多个成员企业组成的为了共同的利益组成的利益联合体。在供应链内部，既有为了各自利益的厉害冲突关系，又有在共同利益之下的合作关系。供应链成员企业的合作伙伴关系研究是供应链管理中的重要课题。 供应链合作关系的起源在于经济的全球化和市场的压力，其中，核心竞争力，不断变化的顾客期望，大规模定制是引领管理潮流的三个主要因素。供应链合作伙伴关系给供应链所有成员带来了内外效益的提高。在伙伴关系的形成过程中，合作伙伴的选择是首要的问题，用模糊数学的综合评价模型能很好地解决这个问题。 针对供应链企业间合作的特点和原则，构建了供应链合作的总体框架，为了实现供应链总成本最小和客户服务水平最高的目标，供应链的合作应该注重信息流的建设，它能带来物流合作的和谐、顺畅。信息技术和物流技术的建设是供应链合作的主要内容。 供应链合作的内在机制是供应链利益的分配和企业收益增长问题。通过供应链契约的形式对供应链企业的利润进行分配，利润的协调是保持供应链稳定的关键因素。本文在市场需求确定和不确定的情况下分析了利润分配问题。供应链中核心企业和成员企业可以看作是委托-代理关系，激励-约束模型可用来分析其激励问题。 最后，本文就供应链企业合作伙伴关系的整体绩效问题进行了分析，以图建立一个科学、客观的评价指标体系，对供应链企业间的合作进行评价，促进供应链的健康运行。