东北地区家鸭地方品种和野鸭遗传多样性及系统发育研究

来源 :东北师范大学 | 被引量 : 2次 | 上传用户:caoshaohua2009
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本实验采集东北地区5个家鸭品种,73个个体;6个地区的家鸭地方品种(采集地点包括黑龙江双鸭山、黑龙江哈尔滨、吉林洮南、吉林白山、辽宁铁岭和辽宁本溪)113个个体;8种野鸭(包括斑嘴鸭、绿头鸭、针尾鸭、赤颈鸭、赤膀鸭、凤头潜鸭、红头潜鸭和鹊鸭)53个个体;总计239个个体的组织或血液样本。通过采集鸭的组织和血液样本提取基因组DNA,测定鸭线粒体DNA D-loop区部分序列来研究东北地区家鸭和野鸭的遗传多样性与系统进化关系。本实验采用鸭线粒体DNA D-loop区约610bp片段进行分析。家鸭的分析结果表明,A、C、G、T这4种核苷酸的平均比例分别为24.6%、16.3%、34.2%和24.9%。共发现40个变异位点(包括绿头鸭和斑嘴鸭),约占分析位点总数的6.6%,插入/缺失位点3个;共确定29种单倍型,11种为共享单倍型;4个家鸭养殖品种和6个地区家鸭单倍型多样度从0.284至0.784,单倍型变异度总体为0.571±0.097,整体的平均核苷酸差异数为1.1561,核苷酸多样度为0.1898%。家鸭群体间核苷酸分析度(Dxy)在0.041%~0.508%之间变化,核苷酸净遗传距离(Da)为0~0.163%之间。结果显示,4个家鸭养殖品种和6个地区家鸭表现出较低水平的遗传多样性,遗传分化不显著。遗传多样性和亲缘关系分析表明,绿头鸭和斑嘴鸭在东北地区家鸭起源进化过程中均有贡献。8种野鸭的分析结果表明,A、C、G、T这4种核苷酸的平均比例分别为25.1%、16.8%、33.4%、24.7%。共发现144个变异多态位点,约占分析位点总数的23.6%;53个个体确定43个单倍型,单倍型多样度总体为0.9503±0.1105;整体的平均核苷酸差异数为4.465,平均核苷酸多样度为0.739%,范围在0.233%~1.533%。遗传多样性分析表明,东北地区8种野鸭的遗传多样性高,遗传资源丰富。
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