目前,工业点源污染在国家与社会各界的不断努力下已得到很好的管控,农业非点源污染已成为影响环境水体质量的首要因素,国内外专家学者对此也给予了高度的重视。农业面源污染导致的水体污染已经严重影响到食品安全、饮用水安全和人们的身体健康,严重制约着社会经济的可持续发展。其对农业集约化水平较高的流域地区的影响已经远超工业点源污染。因此,对农业非点源污染的防控不但逐步成为环境管理的重中之重,也成为农业现代化和区域可持续发展的研究热点。巢湖位于安徽省中部,是我国五大淡水湖之一。其得天独厚的地理位置,优越的自然环境和丰富的人文景观为流域内的经济社会发展奠定了坚实的基础。巢湖是合肥及周边地区城市用水的主要来源之一,其水体质量直接影响到流域内社会经济能否健康长久发展。长期以来,由于巢湖流域是我国中部社会生产力发展水平较高的地区,人均耕地较少,土地集约利用程度较高,单位耕地化肥施用量居于于全国前列。化肥的大量使用以及不合理的种植制度不仅制约了农业种植经济发展,而且多余的养分进入环境后,污染土壤、水体和大气,对区域环境质量构成严重威胁。目前,巢湖水体污染严重,流域内生态环境退化,湖底泥沙淤积,蓝藻水华大面积爆发,是全国有名的富营养化湖泊。要从根本上解决巢湖流域水污染问题,宏观上要科学调整农业产业布局,中观上要合理优化农业种植结构。微观层面上要注重对农户种植行为的科学引导。本研究主要依托资源与环境经济学、生态经济学、可持续发展理论,在分析巢湖流域农业面源污染现状的基础上,将农业面源污染控制下的巢湖流域农业种植结构优化这一研究问题转化为：在既定的农作物面源污染总量约束下,如何通过不同农作物种质的优化组合来实现经济效益的最大化。借鉴前人的研究成果,将各种约束参量纳入目标函数,确定农业面源污染控制下种植结构优化模型。查阅收集巢湖流域的各类农业生产数据并进行分析整理,计算出模型中的相关参数。通过对所构建的模型的计算,得出农业种植结构优化的最优解,分析模型是否能较好的模拟农业面源污染控制下的巢湖流域农业种植结构优化,并对模型模拟出的结果与流域实际相结合,提出巢湖流域农业面源污染控制下的种植结构优化路径：巢湖流域种植业应全部采用清洁生产技术(测土配方施肥和有机栽培),粮食播种面积保持在53万公顷,水果用地保持在2.7万公顷左右；蔬菜用地保持在7.5万公顷左右；棉花行情回暖后在旱地扩大棉花种植面积。