内蒙古汉族人泛发型脓疱型银屑病、寻常型银屑病易感基因的研究及鉴定

来源 :内蒙古医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wodekechengsheji
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目的探讨白细胞介素36受体拮抗剂基因(interleukin-36 receptor antagonist gene,IL36RN)、细胞凋亡募集结构域家族成员14基因(caspase recruitment domain-containing protein,CARD14)、肿瘤坏死因子α诱导蛋白3(TNFAIP3)相互作用蛋白1基因(tumor necrosis factorα-induced protein(TNFAIP3)-interacting protein 1,TNIP1)、衔接蛋白复合体1-σ3亚单位异构体基因(theσ1C subunit of the adaptor protein complex 1,AP1S3)、人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)及CSMD1(CUB and Sushi multiple domains1)基因变异与内蒙古汉族人群泛发型脓疱型银屑病(Gerneralized pustular psoriasis,GPP)及寻常型银屑病(psoriasis vulgaris,Ps V)的相关性。方法收集GPP患者136例,Ps V患者1030例,健康对照组965例,根据既往文献报道,选择与GPP及Ps V相关的6个基因区域的17个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP),经过聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)扩增,对以上所有SNP(除HLA-C*06:02外)使用二代测序法,HLA-C*06:02采用序列特异性引物聚合酶链式反应(Sequence specific primer polymerase chain reaction,PCR-SSP)进行基因多态性检测,计算16个SNP的最小等位基因频率(MAF%)及HLA-Cw*06:02阳性在病例组与对照组之间的频率,利用PLINK1.07统计软件对MAF%进行χ2检验,并计算比值比(odds ratio,OR)及其95%可信区间(confidence interval,CI),以P﹤0.05为差异有统计学意义。结果经过统计分析,⑴共有7个基因变异与GPP相关:包括位于IL36RN基因区域的rs148755083(P=2.72E-80,OR=25.63,95%CI=16.26-40.39)、rs139497891(P=2.90E-04,OR=9.66,95%CI=2.15-43.39),位于TNIP1基因的rs17728338(P=1.22E-16,OR=3.51,95%CI=2.57-4.79),位于HLA区域的HLA-Cw*06:02、rs3177928(P=3.18E-07,OR=2.66,95%CI=1.80-3.924)、rs118179173(P=2.30E-02,OR=2.05,95%CI=1.09-3.836);位于CARD14基因区域的rs3813063(P=4.24E-09,OR=2.23,95%CI=1.70-2.93)。⑵共有7个基因变异与Ps V相关:包括位于HLA区域的HLA-Cw*06:02、rs118179173(P=2.30E-06,OR=2.32,95%CI=1.62-3.32)、rs2247056(P=3.73E-04,OR=0.67,95%CI=0.53-0.83)、rs3177928(P=1.37E-15,OR=2.51,95%CI=2.00-3.168);位于TNIP1基因的rs17728338(P=1.35E-04,OR=1.49,95%CI=1.21-1.83)、rs869976(P=9.74E-03,OR=1.72,95%CI=1.14-2.62);位于CARD14基因区域的rs3813063(P=1.21E-02,OR=1.18,95%CI=1.04-1.35)。⑶共有6个基因变异与GPP伴Ps V相关:包括位于IL36基因区域的rs148755083(P=1.27E-34,OR=14.71,95%CI=8.51-25.44);位于TNIP1基因区域的rs17728338(P=9.92E-08,OR=2.90,95%CI=1.93-4.37);位于HLA基因区域的HLA-Cw*06:02、rs118179173(P=1.16E-02,OR=2.49,95%CI=1.20-5.20)、rs3177928(P=6.38E-08,OR=3.30,95%CI=2.09-5.20)和位于CARD14基因区域的rs3813063(P=6.48E-06,OR=2.22,95%CI=1.56-3.16)。⑷共有5个基因变异与GPP不伴Ps V相关:包括位于IL36RN基因区域的rs148755083(P=7.73E-103,OR=47.27,95%CI=5.16-105.70)、rs139497891(P=2.60E-09,OR=23.36,95%CI=5.16-105.70);位于TNIP1基因区域的rs17728338(P=1.32E-13,OR=4.40,95%CI=2.88-6.72);位于CARD14基因区域的rs3813063(P=5.12E-05,OR=2.25,95%CI=1.51-3.36)及位于HLA区域的HLA-Cw*06:02。⑸在HLA-Cw*06:02阴性的样本中,共有6个基因变异仍与GPP有关:包括位于HLA区域的rs118179173、rs3177928;位于IL36RN基因区域的rs139497891、rs148755083;位于TNIP1基因区域的rs17728338、位于CARD14基因区域的rs3813063。在HLA-Cw*06:02阳性的样本中,共有3个基因变异与GPP有关:位于TNIP1基因区域的rs17728338、位于CARD14基因区域的rs3813063、位于IL36RN基因区域的rs148755083。在HLA-Cw*06:02阳性和阴性的样本中,均与GPP有关的3个基因变异是:位于TNIP1基因区域的rs17728338、位于CARD14基因区域的rs3813063、位于IL36RN基因区域的rs148755083。结论⑴在内蒙古汉族人群中证实HLA-Cw*06:02、HLA(rs3177928、rs118179173)、IL36RN(rs139497891、rs148755083)、CARD14(rs3813063)、TNIP1(rs17728338)与GPP具有相关性。⑵在内蒙古汉族人群中,证实HLA-Cw*06:02、HLA(rs118179173、rs2247056、rs3177928)、CARD14(rs3813063)、TNIP1(rs17728338、rs869976)与Ps V具有相关性。未发现AP1S3、CSMD1基因与GPP的相关性。⑶分层分析发现,在内蒙古汉族人群中,IL36RN(rs139497891)与不伴有Ps V的GPP具有相关性;HLA(rs118179173、rs3177928)与伴有Ps V的GPP具有相关性;HLA-Cw*06:02、IL36RN(rs148755083)、CARD14(rs3813063)、TNIP1(rs17728338)与伴有或不伴有Ps V的GPP都具有相关性。⑷以HLA-Cw*06:02分层分析发现,单独在HLA-Cw*06:02阴性的样本中与GPP相关的基因位点为:rs118179173(HLA)、rs3177928(HLA)及rs139497891(IL36RN)。在HLA-Cw*06:02阴性和阳性的样本中均与GPP相关的位点是:位于IL36RN的rs148755083、位于TNIP1的rs17728338和位于CARD14的rs3813063;本研究未发现单独在HLA-Cw*06:02阳性的样本中与GPP有相关性的位点。
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