为保障土壤环境安全和农产品安全，亟需建立适合我国国情的土壤环境保护管理体系和基础支撑体系，而目前我国尚没有完整的土壤环境功能区划的理论体系。为此，本研究尝试建立了我国土壤环境功能区划的指标体系，完成了土壤环境功能区划的方法学研究。主要成果如下:　　(1)根据类型区划和区域区划之间的关系，在土壤环境质量区划的基础上，建立了包括区划原则、区划指标、区划边界、区划命名等在内的土壤环境功能区划方案，将全国划分成75个土壤环境功能区。主要功能区按主导功能的不同，分为耕地（包括耕地、耕地林地、耕地草地）、林地（包括林地、林地耕地、林地草地）、草地（草地、草地耕地、草地林地）和其他用地。　　(2)以耕地为主导功能的三种功能类型，均主要分布在北方地区，在西南地区主要分布在四川盆地地区，在东南地区则主要分布在长江中下游地区。以林地为主导的三种功能类型主要分布西南地区，北方地区主要分布在大小兴安岭和长白山地区，东南地区主要是林地耕地交错地带。以草地为主导的三种功能类型除在青藏区有大面积的草地外，其余均分布在北方地区。其他用地主要分布在北方和青藏的西部地区。　　(3)通过参数调整，建立基于土壤酸碱条件、土壤污染物浓度、土壤环境基准值和背景值的综合风险评估方法，对63个土壤环境功能区进行污染风险评估，全国风险区主要集中在西南、东南区，包括湘赣丘陵林地耕地和桂西喀斯特低山盆地林地耕地高风险区、雪峰山山地林地草地和罗霄山山地林地草地中风险区、乌蒙山凉山山地林地耕地和川南黔中北山地丘陵林地耕地低风险区。　　(4)综合来看，北方地区耕地质量较好，污染主要来源于农药化肥的使用及污灌等农业生产活动，应加强此方面的监管，同时采取有针对性的方式进行修复，整体上可以安全利用;其次是东南地区，主要由搬运累积造成，土壤酸化较严重，应适当添加钝化剂等降低重金属的活性;西南地区相对较差，背景值较高，矿冶活动频繁，加重了土壤中重金属的污染，污染较轻的地区可进行适当的修复，在喀斯特等生态脆弱区，应尽量减少人为活动，避免镉污染的爆发，或者改变土地利用方式。