农民工群体为国家的经济发展做出了巨大的贡献,而农民工市民化这一过程也是中国现代化的必经阶段与关键所在。作为弱势的劳动群体,农民工面对来自城市社会的全方位的社会排斥与多阶剥夺,其作为劳动者的合法权益有时也难以得到保障。在维护农民工权益和减少农民工社会排斥方面,政府和市场都存在着结构性的“失灵”现象,而非政府组织则能够有效的弥补政府在这方面的缺失,全面的向农民工“赋权”。具体的说,非政府组织可以通过在教育培训、职业介绍、权益维护、社会保障、丰富文化生活、降低市民化成本以及扩大政治参与等方面的做为,提升农民工的市民化能力。但在现实中,我国非政府组织本身尚处在萌发阶段,各种法律和法规建设仍有待完善,再加上农民工自身的局限性,导致非政府组织在参与农民工市民化进程中产生了许多问题。本文通过分析中国的具体国情和农民工的现实需求,对非政府组织参与农民工市民化职能进行了界定,剖析了非政府组织问题产生的深层次原因,并借鉴了西方非政府组织参与社会政策及消除贫困方面的有益经验,围绕适合中国非政府组织参与农民工市民化进程的有效路径进行了探讨和研究。