代谢工程改造大肠杆菌合成丁二酸及发酵罐放大工艺

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丁二酸,又名琥珀酸,化学式为C4H6O4,是一种优秀的C4平台化合物,被广泛应用于制备各药物、精细化工产品以及可生物降解的聚合物。传统化学法合成以不可再生资源石油为原料,成本高,环境污染严重。微生物发酵法生产丁二酸,以可再生资源糖为原料,具有成本低,环境污染小的优点。因此进行丁二酸的生物法研究具有极大的现实意义。  由于丁二酸有氧培养阶段为三羧酸循环代谢中间产物积累较少,因此一般采用两阶段培养模式生产丁二酸,有氧阶段提高菌体浓度,厌氧发酵产酸。厌氧阶段产生副产物如乙酸、乳酸、甲酸等降低原料利用率。为提高丁二酸得率,降低副产物产量,同时增强丁二酸合成途径成为构建高产菌株主要手段。本文以大肠杆菌AFP111为出发菌株,进行乙酸合成基因敲除,同时过表达关键基因提高丁二酸得率。首先敲除乙酸激酶和磷酸转乙酰酶(其编码基因为ackA-pta)获得SX01菌株乙酸产量下降了44.86%,丁二酸得率增加了4.55%。在SX01菌株基础上,敲除苏氨酸脱酸酶和2-酮丁酸甲酸裂解酶(其编码基因分别为tdcD和tdcE)获得菌株SX02,乙酸产量减少了15.53%,丁二酸得率提高了5.07%,生产效率下降13.16%。随后为提高糖转运速率,对编码葡萄糖激酶的基因glk启动子改造获得菌株SX03,较SX02的Glk酶活性提升3.66倍,葡萄糖利用率由0.69g/(L·h)增至1.04g/(L·h),丁二酸得率提高8.28%,生产效率提高62.12%,乙酸产量下降31.62%。在SX03菌株的基础上进行编码半乳糖转运体galp进行改造,利用运动单胞菌株密码子优化后的葡萄糖促进蛋白,其编码及因为glf替换galp基因,获得的菌株SX04并无明显效果,反而使Glk酶活性降低了3.97倍,糖利用效率下降,丁二酸得率下降5.73%,此时该替换并无显著效果,可能由于选择启动子启动效率过低。随后以SX03为出发菌株进行磷酸烯醇式丙酮酸激酶基因pck启动子改造后获得菌株SX05,Pck酶活性提高10.58倍,但其丁二酸得率下降4.46%,该菌株Glk酶活性下降45.13%,可能由于Pck催化产生ATP,Glk酶活性受ATP含量调控,ATP含量过高,使得Glk酶活性被抑制,糖转运效率下降,进而导致丁二酸得率下降。  选择高产丁二酸菌株SX03进一步放大,首先以碱式碳酸镁为pH调节剂5L罐发酵,厌氧阶段SX03相比AFP111乙酸产量减少75.76%,生产效率提高72.52%,丁二酸得率1.62mol/mol,提高了19.12%。其次,为降低生产成本以NaOH和Na2CO3替换碱式碳酸镁,优化厌氧发酵阶段pH、搅拌转速、初始葡萄糖浓度,优化结果表明当厌氧阶段pH为6.8、初始葡萄糖含量为100g/L、搅拌转速为250r/min,产生丁二酸72.33g/L,得率为1.66mol/mol,乙酸产量为2.24g/L。最后,将该菌株进行100L发酵罐初步放大验证,结果表明厌氧67h,丁二酸产量为51.95g/L,体积为82L,乙酸产量为1.91g/L,丁二酸得率为1.30mol/mol,生产效率为0.79g/(L·h)。  通过代谢工程改造的大肠杆菌,其乙酸副产物含量显著下降、丁二酸得率提高,并在5L和100L发酵罐上实现工艺放大,展现出较大工业化利用潜力。
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