近年来,国家高度重视职业教育改革发展,职业教育办学规模不断扩大,招生数量大幅度上升,经费来源及经济活动告别原有的单一化、简单化,逐步走向多元化、复杂化,整体上实现了历史性跨越发展。然而,高职院校在快速发展的同时,也逐步显露出一些不能很好适应社会发展的弊病,主要原因之一就是作为保障学校健康发展运行的内部控制体系,建设普遍滞后,作用发挥欠缺,运行效率低下,很难有效适应高职院校的快节奏发展。因此,迫切需要在研究高职院校业务活动特点及运行规律的基础上,建立健全符合高职院校发展需求的内部控制体系。本论文采用案例分析法,以M学院为研究基点,在对高职院校内部控制相关理论、COSO框架以及国内外研究文献进行梳理总结的基础上,依据我国《行政事业单位内部控制规范(试行)》,结合问卷调查结果和有关访谈内容,从单位和业务两个层面分析M学院内部控制现状,探寻缺点和不足,深入剖析该院校当前内部控制体系中的薄弱环节以及导致问题的深层次的原因,确定从完善控制环境、强化风险评估、改进控制活动、加强信息沟通、健全监督体系五个方面入手,有针对性的提出完善M学院内部控制体系的可行性意见,设计具体实施方案,制定行之有效的改革措施,从而优化M学院内部控制体系,改善M学院内部控制现状,提升M学院运行管理水平。通过研究M学院内部控制体系完善过程,为高职院校优化内部控制体系提供了一定的参考和借鉴。高职院校在构建内部控制体系时,不仅要理顺五个要素间的关系,依托制度保障,落实风险评估,强化流程控制,完善信息系统,健全监督评估,还要通过细化各项经济业务和管理活动流程,量化岗位职责,强化关键点控制,使得决策科学、执行坚决、监督有力。