长链非编码RNA GRLAT1在肺腺癌吉非替尼耐药细胞中的作用及机制研究

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目的:研究长链非编码RNA在肺腺癌吉非替尼耐药细胞中的作用及可能的机制。方法:利用人肺腺癌吉非替尼耐药细胞HCC827/GR及其亲本敏感细胞HCC827进行lnc RNA表达谱芯片实验,通过鉴定、生物信息学分析及筛选,挖掘出一个显著差异表达的lnc RNA--NONHSAT093968。设计特异性小干扰RNA(small interfering RNA,si RNA)敲减NONHSAT093968在HCC827/GR中的表达,利用细胞增殖-毒性检测试剂盒(Cell Counting Kit-8,CCK-8)检测吉非替尼对HCC827/GR细胞的半数致死量(the inhibitory concentration to produce 50%cell death,IC50),平板克隆实验检测细胞增殖,流式细胞术检测细胞凋亡及细胞周期分布。在体外建立裸鼠肺腺癌吉非替尼耐药皮下荷瘤模型,观察NONHSAT093968对吉非替尼耐药细胞皮下瘤增殖的影响。利用生物信息学预测NONHSAT093968的靶基因,q RT-PCR和Western Blot实验检测下调NONHSAT093968后对靶基因的影响。Western Blot检测EGFR、NF-κB通路相关蛋白的变化情况,并进行CCK8挽救实验验证。结果:1.我们在lnc RNA表达谱芯片中,发现大量差异表达的lnc RNA可能参与了EGFR-TKI耐药。通过多步筛选策略后,挖掘出一个显著差异表达的lnc RNA--NONHSAT093968。因其在人肺腺癌吉非替尼耐药细胞中显著高表达,我们将其命名为GRLAT1(Gefitinib-resistant lung adenocarcinoma transcript1)。2.下调GRLAT1的表达后,测得吉非替尼对HCC827/GR细胞的IC50降低,增强HCC827/GR细胞对吉非替尼的敏感性。同时,可以显著抑制HCC827/GR细胞增殖,并促进细胞凋亡。在裸鼠皮下荷瘤模型中,敲减GRLAT1后,抑制了HCC827/GR细胞皮下成瘤能力。3.通过对lnc RNA GRLAT1邻近编码基因信息分析,我们发现在其基因位点附近存在CCDC50基因。q RT-PCR和Western Blot实验结果显示下调GRLAT1后,CCDC50的m RNA和蛋白表达水平明显升高。我们在HCC827/GR细胞中通过si RNA下调CCDC50,发现吉非替尼对耐药细胞的IC50升高,降低了HCC827/GR细胞对吉非替尼的敏感性,促进细胞增殖。同时Western Blot检测发现,在敲减GRLAT1后,NF-κB信号通路被抑制。随后,我们进行了CCK8挽救实验。敲减GRLAT1的表达后,HCC827/GR细胞增殖能力明显减弱,这种减弱的趋势能够被下调表达的CCDC50挽救。以上结果提示,GRLAT1通过调控CCDC50促进了HCC827/GR对Gefitinib的耐药性。结论:1.通过lnc RNA表达谱芯片分析,发现GRLAT1是其中介导吉非替尼耐药的关键lnc RNAs之一。2.CCDC50是GRLAT1的功能性靶基因,CCDC50也可以介导吉非替尼耐药。3.GRLAT1可能通过对CCDC50的调控参与了肺腺癌细胞对吉非替尼的耐药。
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