随着经济全球化的不断深入和飞速发展,协同创新俨然成为知识经济时代的热点话题,加之世界经济的关联度、紧密性越来越强,其发展越来越呈现出区域性的特征,国家或区域的协同创新能力已经成为影响国家和地区经济竞争实力的关键所在。我国提出实施创新驱动发展战略,坚持走中国特色自主创新道路,以全球视野谋划和推动创新,提高原始创新、集成创新和引进消化吸收再创新能力,更加注重协同创新。在此背景下,区域协同创新能力的评估问题正日益成为我国乃至国际学术界关注和研究的焦点。在新时期,我国从区域发展的新形势出发,明确提出要实施区域协调发展战略,以疏解北京非首都功能为“牛鼻子”推动京津冀协同发展,从而建立更加有效的区域协调发展新机制。在此背景下,本文以京津冀的区域协同创新能力为研究对象,基于自组织理论对区域协同创新能力进行了研究与分析。首先依据指标体系选取原则,在分析区域协同创新能力影响因素的基础上,自行建立区域协同创新能力评价指标体系;然后基于自组织理论分析粒子群优化算法的适用性,通过阐述区域创新系统的自组织特性以及演化过程,进而分析区域创新系统演化过程与粒子群优化算法的相通性,以奠定本文研究的理论可行性;最后,构建基于粒子群优化算法的区域协同创新能力评估模型,并以指标体系和评估模型为基础,本文对京津冀的区域协同创新能力进行评估分析,为今后京津冀地区的协同发展提出对策和建议。