枯草芽孢杆菌来源谷氨酸脱氢酶的分子改造及其应用

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氧化还原酶是一类重要的生物催化剂,同时作为辅酶再生酶,广泛应用于多种重要的生物催化反应过程,常用的酶包括葡萄糖脱氢酶、甲酸脱氢酶、谷氨酸脱氢酶等。其中谷氨酸脱氢酶(GDH)可催化谷氨酸合成α-酮戊二酸及其可逆反应,过程中伴随着NAD(P)+及NAD(P)H的再生。本论文对GDH表面电荷及稳定性进行了改造,以便进一步提高其在氧化还原反应中的使用效率,主要结论如下:(1)在大肠杆菌中过量表达了八种不同来源的GDH,经过酶活及酶学性质比较,将筛选到酶活较高的Bacillus subtilis 168来源的NADH依赖型BsGDH为研究对象,随后对BsGDH进行酶学性质分析,发现BsGDH具有氧化还原双方向酶活性,其最适催化pH均为弱碱性(分别为pH 8.0和pH 7.5),但在弱碱环境下该酶稳定性较差,该酶在pH 8.0条件下放置35 h后仅剩46%的酶活力,pH 8.5条件下放置半小时就会完全失活;最适催化温度分别为60℃和65℃,该酶热稳定性较差,大于55℃的条件下放置2 h,氧化方向的酶活就会完全丧失,还原方向也仅能保留14%的残留酶活。(2)为了提高BsGDH在氧化还原反应中的经济性,首先基于蛋白表面电荷工程,对该酶进行分子改造,以期将其催化最适pH调至其稳定性较高的中性环境。利用ROSETTA软件选择8个突变候选位点,结果发现突变体N16D、K218D和M277D催化最适pH由8.0下调至7.0,同时酶活较野生型分别提高了2.9倍、5.4倍和3.9倍,但其组合突变体的酶活完全丧失。另外,将BsGDH与其它8种嗜热来源的GDH进行氨基酸序列比对得到突变位点,获到热稳定性明显提高的突变体BsGDHE27F+S70V+S305E,在50℃放置16 h后依然剩余48%的酶活,而野生型放置3 h就完全失活。(3)对BsGDH作为主酶催化合成α-酮戊二酸进行了初步探究。首先考察了辅酶浓度对BsGDH催化的影响,发现辅酶NAD+/NADH浓度越大,其反应速度越快。为了降低辅酶NAD+/NADH添加量,我们利用B.subtilis 168来源的NADH氧化酶(BsNOX)和BsGDH构成辅酶NAD+/NADH耦合循环再生体系,与BsGDH的单酶转化相比,在此耦合体系中,BsGDH生成α-酮戊二酸的反应速率提高了30%。根据先前BsNOX酶学性质分析,BsNOX最适催化pH为9.0,为调整其最适pH,我们通过ROSETTA软件相同的方法设计得到了16个突变位点,筛选得到了最适pH降为7.0,且酶活提高2.9倍的突变体BsNOXN20D+N116E,在组合BsGDHK218D+BsNOXN20D+N116E体系中反应45 min就可以达到90%左右的转化率。(4)探究了BsGDH在辅酶NAD+/NADH循环再生中的应用前景,首先构建了BsGDH与B.cereus来源的亮氨酸脱氢酶(BcLDH)偶联催化体系,发现偶联体系中产量更高、转化速度更快,其中BsGDHK218D-BcLDH体系则可得到60.47 g·L-1 L-苯甘氨酸,而BcLDH的单酶转化体系中,仅产生10.8 g·L-1 L-苯甘氨酸,说明BsGDH及其突变体可以有效应用于NADH的循环再生;另外,构建了BsGDH与B.subtilis 168来源的乙偶姻还原酶(BsAR/BDH)的偶联催化体系。BsAR/BDH单酶转化体系中,仅有14.53 g·L-1乙偶姻生成,而在BsGDHE27F+S70V+I331P-BsAR/BDH偶联体系中反应速率加快并且生成30.93 g·L-1的乙偶姻,说明BsGDH可以有效应用于NAD+的循环再生。
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