【摘 要】
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目的:本研究综合基因表达数据库（gene expression omnibus,GEO）中三个感染性休克基因数据集进行深度分析,通过动物模型和临床数据进行验证,以期找出感染性休克的核心基因。方法:1.从基因表达数据库（Gene Expression Omnibus,GEO）数据库中下载[GSE131761（GPL13497平台）],[GSE119217（GPL16686平台）]和[GS E2637
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目的:本研究综合基因表达数据库（gene expression omnibus,GEO）中三个感染性休克基因数据集进行深度分析,通过动物模型和临床数据进行验证,以期找出感染性休克的核心基因。方法:1.从基因表达数据库（Gene Expression Omnibus,GEO）数据库中下载[GSE131761（GPL13497平台）],[GSE119217（GPL16686平台）]和[GS E26378（GPL570平台）]数据集。这三个数据集包括204个感染性休克样本和48个正常样本。R包“affy”和“limma”用于鉴定脓毒症休克与正常样本的差异表达基因（Differently expressed genes,DEGs）。应用加权基因共表达网络分析（Weighted gene co-expression network analysis,WGCNA）来寻找在感染性休克中发挥重要作用的模块。利用DEGs的功能注释和枢纽基因的构建与分析探讨感染性休克的发病机制。2.构建了感染性休克动物模型来分析这些核心基因的作用。3.收集临床数据,对核心基因表达情况和基因表达相关临床指标进行验证,发掘核心基因的临床意义。结果:1.合并的数据集包含321个上调基因和255个下调基因。WGCNA显示棕色模块与感染性休克状态的相关性最高。棕色模块基因的GO和KEGG富集分析结果显示,它们主要富集在“白细胞分化”、“Ras-prox imate-1（Rap1）信号通路”和“细胞因子-细胞因子受体相互作用”中。通过构建和分析蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络,IL10、C3AR1、CD63和TIMP1被确定为感染性休克的核心基因。动物模型中PCR和ELI SA结果显示septic shock组CD63的相对表达水平高于con组（P＜0.05）,septic shock组C3AR1的相对表达水平低于con组（P＜0.05）。2.在动物模型中,感染性休克组白细胞介素-6（IL-6）、肿瘤坏死因子-α（TNF-α）、乳酸的相对表达量明显高于对照组。定量逆转录PCR（q uantitative reverse transcription PCR,RT-q PCR）和酶联免疫吸附试验（en zyme linked immunosorbent assay,ELISA）结果显示,与正常对照组小鼠相比,感染性休克组小鼠CD63表达明显升高,感染性休克组小鼠C3AR1表达明显降低（P＜0.05）。3.临床数据显示septic shock组IL-10高于con组（P＜0.001）,而血小板计数低于con组（P＜0.001）。结论:经过生物信息学分析发现IL-10、C3AR1、CD63和TIMP1是感染性休克的核心基因,在感染性休克病理过程中发挥重要作用。在感染性休克动物中可见C3AR1、CD63表达差异。在感染性休克患者中可见IL10表达差异。
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