云南省边境地区麻疹流行特征和基因特征分析研究

来源 :昆明医科大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:xigua871030
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目的通过对云南省边境地区2013年麻疹流行病学特征和人群免疫情况的描述和分析,了解边境地区麻疹在不同人群、地区、时间的分布情况和人群免疫状况。通过对边境地区麻疹的分子生物学监测,掌握云南省边境地区麻疹病毒株基因的型别及与代表毒株相关性,为云南省边境地区及全省麻疹防控策略和措施的制定提供科学依据,对推进全省麻疹消除进程具有重要的现实意义。研究方法采用描述性流行病学方法,描述云南省边境地区2013年麻疹流行病学特征和人群免疫情况。采用实验流行病学方法,使用Vero/SLAM细胞(淋巴信号激活因子转染的非洲绿猴肾细胞)进行麻疹病毒的分离培养,用逆转录一聚合酶链反应(RT-PCR)检测方法对病例进行确诊和分离病毒的鉴定,对未分离到病毒的标本直接提取病毒核酸并进行RT-PCR和基因测序。描述性流行病学研究的数据录入使用Epidata3.0软件,录入后导出Excel后进行整理。数据分析利用SPSS17.0软件。实验流行病学研究的数据与WHO代表株N基因羧基末端450个核苷酸序列做比对,用MEGA5.1软件进行序列基因亲缘关系分析,做基因亲缘性进化树。结果云南省边境地区2013年麻疹流行病学特征:(1)本研究共报告麻疹确诊病例141例(含实验室确诊和临床诊断)。(2)年龄分布:发病比例最高的年龄组为20-49岁成人组,占58.86%(83/141),其次是0-1.5岁儿童,占27.66%(39/141);从年龄别发病率来看,0-1岁组的婴儿年龄别发病率最高68.56/10万(34/49592)。(3)男女性别比例为0.94,但1岁年龄组男女性别比为3.0。(4)各职业人群中,农民发病52例(36.8%),散居儿童发病48例(34.04%),其他职业的发病较少。(5)发病特征:发病有明显的季节性,春夏季为边境地区麻疹的高发季节,发病115例,占全年发病的81.56%,暴发和散发麻疹疫情均有相同的季节性规律。除瑞丽市、陇川县和孟连县外均有麻疹病例发生,高发区主要集中在芒市15.66/.10万(62/395913)、临翔区7.67/10万(25/325945)、思茅区6.07/10万(18/296540)、勐海县4.84/10万(13/268595),均高于全省发病率3.04/10万。(6)免疫史:麻疹病例中仅有23例(16.31%)病例有确切免疫史,“0”剂次麻疹病例有70例(49.65%),免疫剂次不详的麻疹病例有48例(34.04%)。按年龄分布情况为:<8月龄18例、≥18岁88例,占75.18%(106/141),为现行免疫策略覆盖外人群;8月龄-6岁共31例,为适龄接种人群,病例中有确切接种史的病例仅有13例(41.94%),“0”剂次麻疹病例有16例(51.61%),免疫史不详2例(6.45%)。(7)麻疹疫苗接种情况:云南省边境地区各县(区)2013年含麻疹组份疫苗的报告接种率均大于98%。云南省边境地区2013年麻疹病毒监测及基因特征:(1)麻疹病毒分离:共收集到393份标本,有19份标本发生CPE,其中尿液标本13份,分离率6.84%,咽拭子标本6份,分离率2.96%。对未分离到病毒株麻疹病例标本提取核酸,共获取30株病毒核酸。(2)RT-PCR结果:PCR产物纯化后,经2%琼脂糖凝胶电泳鉴定,均在700bp处有一明显阳性带。(3)麻疹病毒基因型分布:19株分离到的病毒及30株病毒核酸经基因序列测定和分析,共存在3种基因型,其中HI基因型分布于5个边境县(区),老挝勐赛省南磨县及缅甸贵概;D9基因型分布于德宏州与缅甸接壤的3个县及保山市龙陵县和缅甸勐惹、木姐、贵概;A基因型来源于德宏州芒市。(4)基因亲缘性关系分析:用MEGA5.1软件对病毒分离物和病毒核酸做基因亲缘性关系分析。结果提示,12株为H1基因型的H1a基因亚型(24.49%),36株为D9基因型(73.47%),1株为A基因型(中国沪191疫苗株、2.04%)。(5)36株D9基因型与世界卫生组织D9基因型代表株比较:分为5个组(代表株单独为一组)。各组间核苷酸同源性为96.0%-99.5%,氨基酸同源性为95.2%-99.3%。Custer1和Cluster2仅包含缅籍毒株,Cluster3、Cluster4均由云南省本土分离株和缅籍毒株组成(6)12株H1a亚型和世界卫生组织H1a基因亚型和H1b基因亚型代表株比较:分为4个组(代表株各为一组)。各组间核苷酸同源性为97.1%-99.1%,氨基酸同源性为95.8%~99.3%。Cluster1仅包含1株缅籍毒株,Cluster2由云南省本土分离株和老挝籍毒株组成。(7)D9基因型麻疹疫情暴发的监测:2013年5~8月,德宏州芒市风平镇共发生麻疹暴发疫情3起,涉及病例22例,病例数在2~13例之间;3起暴发疫情共涉及13个自然村(社),其中3个村发生点状暴发(相章村、老光村、芒赛村),采集病原学标本,分离到活病毒3株和检测到5株病毒核酸,合计8株,均为同一起暴发疫情中分离和检测到的D9基因型病毒株。(8)1株A基因型和世界卫生组织A基因型代表株比较,核苷酸同源性为99.1%,氨基酸同源性为99.3%。结论云南省边境地区2013年麻疹发病比例最高的年龄组为20~49岁成人组(58.86%),其次是0~1.5岁儿童(27.66%);其中0~1岁的婴儿年龄别发病率最高(68.56/10万);发病以农民(36.88%)和散居儿童(34.04%)为主,共100例(70.92%);冬春季为麻疹高发季节;高发区主要集中在德宏州(芒市)、临沧市(临翔区)、普洱市(思茅区)、西双版纳州(勐海县)4个边境州(市)所辖的4个县(区),4个县的发病率均高于全省发病率(3.04/10万);病例中仅有23例(16.31%)病例有确切免疫史,适龄接种人群病例中有确切免疫史者仅占41.94%(15例),无免疫史者(“0”剂次)占51.61%(16例)。在云南省边境地区,存在H1和D9两种基因型麻疹病毒的循环,D9基因型是由缅甸输入的,现为德宏州的优势基因型,且该基因型在德宏州与缅甸接壤的边境县和缅甸相互传播;H1基因型在老挝和云南省与老挝接壤的边境地区相互传播。A基因型为中国沪191疫苗株相似株。
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