【摘 要】
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北京地区番茄、丁香及大丽花植物上均出现了黄化、花叶、皱缩等病毒病症状,使自身价值受到了不同程度影响。本文通过小RNA深度测序技术对北京地区侵染番茄、丁香和大丽花植物的病毒进行鉴定,明确病毒种类并构建部分病毒侵染性克隆,为相关植物病害防治提供基础,实验结果如下:1.使用小RNA深度测序技术检测出番茄上带有番茄褪绿病毒(Tomato chlorosis virus,ToCV)、番茄花叶病毒(Tomat
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北京地区番茄、丁香及大丽花植物上均出现了黄化、花叶、皱缩等病毒病症状,使自身价值受到了不同程度影响。本文通过小RNA深度测序技术对北京地区侵染番茄、丁香和大丽花植物的病毒进行鉴定,明确病毒种类并构建部分病毒侵染性克隆,为相关植物病害防治提供基础,实验结果如下:1.使用小RNA深度测序技术检测出番茄上带有番茄褪绿病毒(Tomato chlorosis virus,ToCV)、番茄花叶病毒(Tomato mosaic virus,ToMV)和一种新的卫星 RNA病毒(satellite RNA,Sat RNA)。①设计特异性引物扩增ToCV全序列并分析其基因组结构及酶切位点,选择pCB301载体,用无缝克隆方法成功构建侵染性克隆pCB301-ToCV并转入农杆菌浸润本氏烟及番茄,本氏烟接种7天后在系统叶中检测出ToCV,番茄接种15天后只在接种叶中检测出ToCV,pCB301-ToCV可以侵染烟草,不能侵染番茄,且在本氏烟中没有症状产生。②设计特异性引物扩增Sat RNA全序列并分析其基因组结构及酶切位点,选择pCB301载体,用双酶切方法成功构建侵染性克隆pCB-Sat RNA并转入农杆菌侵染本氏烟和番茄,本氏烟接种7天后检测,番茄接种15天后检测,均没有检测到Sat RNA。③由于Sat RNA病毒不能自己复制和移动,完全依赖于辅助病毒进行复制和包被,因此与pCB301-ToCV一起侵染本氏烟及番茄研究pCB-Sat RNA是否是ToCV的一种Sat RNA病毒,通过实验得出该Sat RNA与ToCV无关。2.丁香黄化曲叶病毒(Lilac vellow leaf curl virus,LYLCV)为本实验室发现的新病毒,已经获得了全序列,在此基础上分析LYLCV基因组结构和酶切位点,选择pCAMBIA1300载体,用双酶切方法分两部分成功构建了 pCAMBIA1300-LYLCV侵染性克隆并转入农杆菌浸润本氏烟,7天后在本氏烟接种叶和系统叶中检测到LYLCV,在本氏烟中没有明显症状产生。3.通过小RNA深度测序技术检测出大丽花上带有黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)、大丽花普通花叶病毒(Dahlia common mosaic virus,DCMV)和一种暂时命名为大丽花矮化相关病毒(dahlia stunt-associated virus,DSaV)的新病毒。①设计特异性引物扩增DCMV-BJ全序列,经过NCBI网站比对与ICTV网站各病毒科基因组描述,DCMV-BJ属于花椰菜花叶病毒科(Caulimoviridae)花椰菜花叶病毒属(Caulimovirius),其基因组为双链DNA病毒,全长7949 bp。该病毒编码运动蛋白、蚜虫传播因子蛋白、DNA结合蛋白、衣壳蛋白、聚合酶多聚蛋白和包涵体蛋白。通过相似性比对与系统发育树的构建判断DCMV-BJ为DCMV-NZ的一个相似度极高的分离物。②设计特异性引物扩增DSaV全序列,经过NCBI网站比对与ICTV网站各病毒科基因组描述,D SaV属于伴生豇豆病毒科(Secoviridae)豇豆花叶病毒亚科(Comovirinae)蚕豆病毒属(Fabavirus),其基因组为两条正义单链RNA,RNA1全长5560 bp,RNA2全长3460 bp。RNA1编码辅酶因子、解旋酶、病毒基因组连接蛋白、蛋白酶、RNA依赖性的RNA聚合酶;RNA2编码运动蛋白、大外壳蛋白和小外壳蛋白。通过相似性比对与系统发育树的构建判断DSaV为蚕豆病毒属的一个新成员。
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