茶叶是云南省重要的传统支柱产业,茶区面积居全国第一。云南是茶树的起源中心和物种分布中心,分布有众多的阿萨姆古茶树及居群、野生大理茶及居群,国家茶树种质勐海分圃保存茶树种质资源1051份,大叶茶种质资源居全国第一。由于人为破坏等因素,野生大理茶等茶树资源处于濒危状况。然而,对于云南茶树资源,系统的遗传多样性研究仍然空缺,云南茶树资源遗传多样性的研究已迫在眉睫。鉴于此,作者对云南茶树资源分别开展了:(1)云南茶树资源的形态多样性和生化多样性分析;(2)云南茶树资源遗传多样性分析;(3)基于DNA条形码原理应用.AFLP技术鉴别阿萨姆茶古茶树及普洱茶晒青毛茶。　　 通过对茶Camellia sinensis、阿萨姆茶C.sinensis var.assamica和大理茶C.taliensis的形态性状、生化性状的系统分析,结果表明:云南茶树资源在形态和生化性状上多样性高,其中阿萨姆茶多样性最高,大理茶多样性最低。不同茶区阿萨姆茶形态和生化性状存在差异;对云南典型茶树资源茶组植物、阿萨姆茶、大理茶,采用ISSR标记和AFLP标记对其进行遗传多样性分析,结果揭示:茶组植物间遗传变异广泛。阿萨姆茶古茶树遗传多样性水平高。不同类型阿萨姆茶古茶园间存在显著的遗传差异。但研究显示大理茶遗传多样性水平很低,部分居群处于濒危状态;基于遗传多样性原理,采用AFLP-毛细管电泳技术鉴别来自不同地区的阿萨姆古茶树和普洱茶晒青毛茶,结果表明AFLP-毛细管电泳技术是一种高效的分子标记技术,能成功鉴别不同地区的阿萨姆古茶树和普洱茶晒青毛茶。　　 本次研究是首次系统地从形态学、生化和分子水平三个层次综合分析阿萨姆茶、大理茶遗传多样性。研究揭示阿萨姆茶古茶树遗传多样性高,首次发现大理茶遗传多样性低,其濒危原因主要是人为破坏等因素。基于遗传多样性水平,我们提出:阿萨姆茶古茶树和大理茶保护策略应包括原地保护和异地保护,大理茶应在原地保护、建立原生境保护区的基础上,异地保护重点居群。研究获得的阿萨姆茶、大理茶形态性状和生化数据,为将来阿萨姆茶古茶树和大理茶的利用奠定了良好基础。而本研究获得的AFLP-毛细管电泳鉴别普洱茶晒青毛茶的专利技术,成功鉴别了不同来源的晒青毛茶,将有利于普洱茶原产地的保护,促进普洱茶产业的健康发展。