【摘 要】
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第一部分中国地区皮肤癣菌病流行病学回顾性研究背景:皮肤癣菌病是最常见的真菌感染性疾病,其流行病学在不同国家和地区存在较大差异,中国地区皮肤癣菌病的流行情况尚不清楚。目的:了解中国地区过去三十年中皮肤癣菌病和甲真菌病的流行病学情况。方法:收集并分析1991年至2020年间所有发表的有关中国大陆地区皮肤癣菌病和甲真菌病流行病学研究的相关文献。结果:（1）对纳入的124篇文章包含超过18万确诊为皮肤癣菌
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第一部分中国地区皮肤癣菌病流行病学回顾性研究背景:皮肤癣菌病是最常见的真菌感染性疾病,其流行病学在不同国家和地区存在较大差异,中国地区皮肤癣菌病的流行情况尚不清楚。目的:了解中国地区过去三十年中皮肤癣菌病和甲真菌病的流行病学情况。方法:收集并分析1991年至2020年间所有发表的有关中国大陆地区皮肤癣菌病和甲真菌病流行病学研究的相关文献。结果:（1）对纳入的124篇文章包含超过18万确诊为皮肤癣菌病病例进行分析研究。结果发现在皮肤癣菌病中,股癣（24.92%）是最主要的临床类型,其次是足癣（22.97%）和体癣（18.12%）。近10年,足癣（25.40%）占比超过股癣（22.39%）成为最常见的感染类型。在皮肤癣菌中,红色毛癣菌（69.48%）始终是最常见的致病菌,其次是须癣毛癣菌（16.45%）和犬小孢子菌（8.09%）。其他菌种的占比均低于3%。在浅部真菌病中,皮肤癣菌占75.52%,高于酵母菌（21.83%）和霉菌（2.65%）。头癣占比在经济发达的东部地区较经济相对落后的中部和西部地区明显降低,而股癣在温暖地区比寒冷地区更常见。（2）本研究共纳入90篇文章,包含4万多名确诊为甲真菌病患者。我们发现皮肤癣菌（60.59%）是甲真菌病中最常见致病菌,其次是酵母菌（30.09%）、霉菌（7.91%）和混合感染（1.41%）。皮肤癣菌、酵母菌和霉菌中最主要病原体分别为红色毛癣菌（79.31%）、白念珠菌（36.58%）和曲霉（44.44%）。此外,与女性相比,皮肤癣菌更易感染男性人群（63.69%对51.57%）,并且主要与趾甲的甲真菌病有关（75.63%）。而酵母菌在女性人群中的发病率高于男性人群（40.97%vs.29.52%）,常导致指甲的甲真菌病（41.03%vs.17.08%）,且南方温暖潮湿地区多于北方地区（34.07%vs.24.41%）。结论:皮肤癣菌病中最常见的三种临床类型分别为股癣、足癣和体癣,皮肤癣菌中最常见三种致病菌为红色毛癣菌、须癣毛癣菌和犬小孢子菌。在甲真菌病中,皮肤癣菌,尤其是红色毛癣菌始终是最主要致病菌,其次为酵母菌、霉菌和混合感染。此外,研究表明,社会经济状况、地理气候条件、性别和感染部位均会对浅部真菌病及其病原菌的分布产生影响。第二部分红色毛癣菌和紫色毛癣菌致病差异的机制研究背景:红色毛癣菌和紫色毛癣菌在基因水平上有99.38%的一致性,但两者在流行病学,表型及临床表现上却相差甚远。目的:了解红色毛癣菌和紫色毛癣菌DNA甲基化修饰情况,探索两者在DNA甲基修饰中的差异及其对转录水平的影响。方法:通过亚硫酸盐测序（BS-seq）及转录组测序（RNA-seq）技术对5株红色毛癣菌和5株紫色毛癣菌进行全基因组测序和转录组测序。结果:红色毛癣菌和紫色毛癣菌在DNA甲基化修饰上存在差异,红色毛癣菌甲基化水平高于紫色毛癣菌,两者共鉴定出681个差异甲基化修饰区域,其中紫色毛癣菌相比红色毛癣菌表达上调的有466个,表达下调的有215个。在转录水平上,共鉴定出1050个存在差异表达的基因,其中,紫色毛癣菌相比红色毛癣菌表达上调的有755个,表达下调的有295个,差异基因GO和KEGG富集主要集中与代谢产物的生成及能量代谢途径方面。甲基化和转录组差异一致性基因有11个,涉及菌株的生长、代谢、毒力及耐药等方面。结论:红色毛癣菌和紫色毛癣菌在菌株的生长、代谢、毒力和耐药方面DNA甲基化修饰上存在差异,并影响转录调控,从而造成两者在表型和致病力方面的差异。
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