RAPD分析江西赣州(贡江)水系鲤鱼(Cyprinus carpio)种群遗传多样性

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用RAPD技术分析了江西赣州地区(瑞金,兴国,赣县,于都,会昌5个采样点)水域鲤鱼遗传多样性。在25个随机引物中,筛选了11个多态引物,对赣州地区5个采样点水域鲤鱼进行PCR扩增。根据遗传相似率和遗传距离,重建了5个县域鲤鱼之间的亲缘关系。11条多态引物,PCR扩增共得到条带1772条,其中特异性条带占总条带数百分比达到85.04%。在种群水平上,平均期望杂合度(He),Shannon指数(I)和多态位点百分率分别为0.27088,I=0.39562,PPB=66.20%。在物种水平上,平均期望杂合度(He),Shannon指数(I)和多态位点百分率(PPB)分别为0.3232,0.4789,PPB=85.01%。其中,瑞金地区鲤鱼(RJ)群体相对其他三个群体遗传多样性较高(H=0.2919;I=0.4241;PPB=70.3%)。从遗传距离表和UPMGA系统发生树上发现:各群体间的遗传距离(SD)在0.1371-0.2192之间,平均遗传距离为0.17636,各群体间的遗传相似系数(SI)在0.8032-0.8719之间,平均遗传相似系数0.8418。Nei’s遗传多样性分析表明群体间基因流水平较低(Gst=0.3217;Nm=1.0541)。以上说明,赣州地区各县域鲤鱼群体发生了一定的分化。其中,瑞金地区和兴国地区两群体亲缘关系最为紧密,而瑞金地区和会昌地区两群体亲缘关系较远。从实验结果来看,系统分化以及基因交流的影响主要来自于地理环境因素。
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