2000-2016年,我国高校共发生了311次合并,涉及院校近千所,其中2000年达到了合并次数的顶峰,该年我国高校经历了 121次合并。此外,在统计时间内,我国有450所高校进行了更名。理论上讲,高校的更名合并对于院校和教育部来说是双赢的,然而经过本文的分析,高校更名或合并对于高校科技创新效率的影响是显著负的(高校科技创新效率指高校进行科技产出时的效率,本文选取高校在国内外期刊论文发表的数量作为产出指标,高校的资本投入及人力投入作为相应的投入指标,运用随机前沿分析的方法拟合出高校的科技创新效率),但针对不同院校,结果具有一定的异质性。本文将高校更名分为四种类型,分别是学院更名为大学、专科升本科更名、同级改名不涉及升格以及因合并而更名;合并分为三种类型,分别是“985高校”合并“非211高校”、“211高校”合并“非211高校”以及“非211高校”之间合并,在此基础上进行异质性分析。结果来看,学院改名大学以及同级改名对于高校的效率影响均是显著负的,而专科升本科的更名对于高校的科技创新效率影响则不显著。对于合并的异质性,相对而言,“985高校”合并“非211高校”对效率的影响是显著正的,“211高校”合并“非211高校”对效率的影响则并不显著,“非211高校”之间的合并则会对高校科技创新效率会产生较为负面的影响。除此之外,本文还探讨了高校分校区相关的问题,对于更名而言,高校分校区的数量的越多,更名对高校科技创新效率的负面影响并不会显著增加;对合并而言,高校分校区的数量越多,合并对科技创新效率造成的负面影响越大。本文也探究更名或合并与高校主校区与分校区平均距离远近的异质性影响。结果表明,高校的主校区与分校区的平均距离越大,更名或合并对于高校的科技创新效率的负面影响也越大。