高校治理在国家治理中发挥着重要作用。高校治理现代化不仅是落实国家“放管服”改革要求,更是提升学校综合实力的根本保障。随着高校改革的不断推进,高校治理现代化的重点逐步转移到内部控制建设方面。预算管理作为内部控制的核心内容,在整个内部控制建设中发挥着举足轻重的作用。因此,基于高校治理现代化视角,对高校预算管理内部控制进行研究具有重要意义。本文坚持以问题为导向,以新公共管理理论、委托代理理论和绩效评价理论为研究的理论基础,以高校预算管理内部控制为研究对象,采用文献研究法、问卷调查法、案例分析法,从高校治理现代化视角对N大学预算管理内部控制进行研究。首先梳理了高校治理现代化、高校内部控制和高校预算管理方面国内外研究现状,提出论文研究思路。其次,通过对N大学预算管理内部控制组织架构、制度方面和预算编制、预算执行与调整、预算监督、绩效评价方面的现状分析,发现N大学在预算管理内部控制方面存在的问题主要包括四个方面:一是预算编制缺乏科学性与合理性,二是预算执行与调整控制不规范,三是预算监督不到位、过程管控不严谨,四是绩效考核指标不合理、绩效评价不全面。最后,从内部控制环境、风险评估、高校治理、信息沟通和交流四个方面对存在问题的原因进行分析,提出分别以法治意识、风险意识、治理能力和监督作用为目标而实施的优化内部控制环境、加强风险评估机制建设、加强控制活动管理和加强沟通与交流四个方面的优化措施。本研究对提升N大学治理现代化,实现高等教育内涵式发展,优化预算管理内部控制建设具有一定的指导意义。同时通过以点带面的方式,对我国其他高校预算管理内部控制建设提供了一定的参考价值。