自1978年在我国出现以来,加工贸易一直是我国外贸的重要组成。近年来经济全球化、加工贸易转型升级、中美经贸摩擦等因素的影响下,加工贸易出现了许多新的发展特点,加工贸易的主体、方式、产品结构,企业的诉求等也都悄然发生着变化,对加工贸易税收制度本身和海关税收征管都提出了新的要求。分析我国加工贸易运行流程和海关监管中的涉税问题,在防止加工贸易税款流失的同时,讨论如何实现加工贸易税收的有效征管和贸易便利化的共赢,是一项摆在海关面前具有实践意义的课题。本文着重从博弈论、税收中性原则、税收功能理论的角度分析海关对加工贸易税收制度的态度,进而对加工贸易与一般贸易的区别进行探讨,提出加工贸易税负优势明显的观点。随后从海关对加工贸易监管尤其是料件监管的要求出发,对料件的状态导致税收变动的情况作了分析,认为实际上海关监管的视线最终都聚焦在加工贸易料件之上,故而加工贸易海关监管的难点,最终可以归结为厘清料件的变化与税收的关系。料件的保税性质赋予了加工贸易特殊的属性,如果料件的采购、生产以及最终复出口严格按照海关监管要求进行,那么税收征管方面的问题将在很大程度上被杜绝。接下来从加工贸易运行流程和征管技术的实践层面对涉税问题进行探讨,简要分析企业和海关两个维度导致加工贸易领域涉税问题产生的原因。随后通过对宁波海关处理的一起加工贸易违规案件分析加工贸易违规行为涉税问题处置和税收补偿问题。最后结合加工贸易转型升级和中美贸易摩擦等大背景,提出应对加工贸易涉税问题的建议和思考。本文立足加工贸易工作,运用文献研究、案例分析等研究方法,在税收理论研究的基础上结合实际工作案例,从税收角度提出了规范和促进加工贸易发展的对策建议。