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科研经费是高等学校从事科学研究活动的前提条件，对科研经费的管理是一项复杂的系统工程。采用“课题制”对研究经费进行全成本核算是科研经费管理的有效手段，也是目前许多高校在科研经费管理实践中所面临的新课题。本文从高校科研经费实行全成本核算面临的问题入手，对科研经费课题制管理进行了深入的研究和分析。研究表明：高校科研经费的全成本核算是今后科研经费管理的发展趋势。