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目的
研究中国北方汉族儿童卷曲蛋白6基因编码区单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)与神经管缺陷(neural tube defects,NTDs)发生的相关性。
方法采用PCR扩增和测序的方法对135例NTDs患儿和135例对照者卷曲蛋白6基因编码区3个错义单核苷酸多态位点(rs827528,rs3808553,rs12549394)进行基因分型及统计学分析。
结果rs3808553等位基因T和基因型TT在病例组中的频率显著高于对照组,T等位基因和TT基因型儿童发生NTDs的危险性分别是G等位基因和GG基因型的1.575倍(OR=1.575,95% CI 1.112~2.230,P=0.010)和2.811倍(OR=2.811,95% CI 1.325~5.967,P=0.023);其余2个多态位点在两组间等位基因与基因型分布差异不具有统计学意义。3个SNPs位点间的单体型A-G-C在病例-对照组间分布具有统计学意义(OR=0.560,95% CI 0.378~0.830,P=0.004),而单体型A-T-C在病例-对照组间分布也具有统计学意义(OR=1.670,95% CI 1.126~2.475,P=0.011)。
结论中国北方汉族儿童中卷曲蛋白6基因rs3808553位点多态性与NTDs发生具有明显相关性,基因型TT使NTDs发生的危险度增加,而rs827528和rs12549394位点多态性与NTDs发生无明显相关性。