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准噶尔无叶豆（Eremosparton songoricum）是豆科无叶豆属小半灌木，既能开花结实进行有性繁殖，又可以靠根茎进行无性克隆繁殖，为国家三级保护植物，在中国仅片断化分布于新疆古尔班通古特沙漠局部区域。本文采用ISSR分子标记对采自古尔班通古特沙漠腹地及边缘的7个准噶尔无叶豆自然居群共148个个体进行了遗传变异和克隆多样性分析。8个引物共扩增出84个位点，其中77个为多态性位点，物种水平上的多态位点百分比PPB为91．67％，Nei’s基因多样性指数，为0．3192，Shannon信息指数助0．