2016年~2017年我国华北地区猪繁殖与呼吸综合征病毒类NADC30毒株分子遗传演化分析

来源 :中国动物传染病学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yayanorman
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为了解近期我国华北地区猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的类NADC30流行及遗传变异情况,本研究自2017-2018年采集华北四省市(北京、天津、山东及河北省)部分猪场疑似PRRSV样品239份进行RT-PCR检测,对所有阳性样品的ORF5基因测序分析及部分阳性样品病毒分离,并选择1株基因缺失病毒(TJjh1602)进行全基因的序列扩增及分析。结果显示,PRRSV检测总阳性率44.35%(106/239),遗传进化显示52.83%(56/106)的流行毒株与类NADC30相近且位于系谱1(lineage 1),其中32.14%(18/56)的类NADC30流行毒株具有相同特征性的氨基酸位点缺失(ORF5氨基酸34位)。基因缺失类NADC30分离毒株(TJjh1602)全基因长度为15018nt,与NADC30同源性为95.2%,除具有上述特征性氨基酸位点缺失外,无其他插入或缺失,研究结果推测类NADC30毒株在我国华北地区广泛流行,同时遗传演化成一类具有ORF5编码区缺失分子标签的新型类NADC30毒株,提示需进一步加强对该新型缺失毒株的流行病学调查及相关致病力研究。
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