【摘 要】
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目的:探讨Graves病患者外周血单个核细胞(PBMCs)中环状RNA(circRNA)的表达谱及其潜在的诊断价值.方法:选取5例Graves病患者和5例健康对照者,采用二代高通量测序技术分析PBMCs中circRNA表达谱.另选取40例Graves病患者和40例健康对照者验证差异表达的circRNA;根据CircInteractome数据库预测可能与差异表达的circRNA相结合的微小RNA(miRNA);运用生物信息学分析差异表达的circRNA潜在的生物学功能;ROC曲线分析差异表达的circRNA
【机 构】
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江苏大学附属人民医院内分泌科,江苏 镇江 212002;江苏大学附属人民医院医学检验科,江苏 镇江 212002
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目的:探讨Graves病患者外周血单个核细胞(PBMCs)中环状RNA(circRNA)的表达谱及其潜在的诊断价值.方法:选取5例Graves病患者和5例健康对照者,采用二代高通量测序技术分析PBMCs中circRNA表达谱.另选取40例Graves病患者和40例健康对照者验证差异表达的circRNA;根据CircInteractome数据库预测可能与差异表达的circRNA相结合的微小RNA(miRNA);运用生物信息学分析差异表达的circRNA潜在的生物学功能;ROC曲线分析差异表达的circRNA对Graves病的诊断价值.结果:二代高通量测序数据显示,与健康对照相比,Graves病患者PBMCs中circRNA有23215个表达上调,13695个表达下调,其中显著差异表达(差异倍数≥2,P≤0.05)的有669个,包括360个上调和309个下调的circRNA.实时荧光定量PCR验证显示hsa_circ_0114427、hsa_circ_0007470、hsa_circ_0048232、hsa_circ_0002672表达水平与高通量测序结果一致,且两组间差异具有统计学意义(P<0.01和P<0.05),hsa_circ_0039161和hsa_circ_0002600表达两组间无明显差异.GO富集分析显示,上调的circRNA与高分子代谢、细胞内膜结合细胞器、转移酶激活等过程关系密切.KEGG分析显示,差异表达的circRNA可能参与甲状腺激素信号、磷脂酰肌醇信号系统、非小细胞肺癌等相关信号通路.ROC曲线显示hsa_circ_0114427具有较大的曲线下面积.结论:Graves病患者PBMCs中存在明确差异表达的circRNA,hsa_circ_0114427可能与Graves病的发生发展有关.
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