【摘 要】
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利用生物信息学方法,对萝卜全基因组SUS基因家族成员进行鉴定与表达分析,结果表明:1)从萝卜基因组中鉴定出7个SUS基因家族成员,且每个家族成员均包含3个保守基序,外显子数量为11~14个。2)根据进化树聚类结果,7个SUS基因家族成员可分为3大类,即SUSⅠ、SUSⅡ和SUSⅢ,它们分别包含2个、2个和3个SUS基因家族成员。3)这7个SUS基因家族成员分布在4条染色体上,7号染色体上分布有3个SUS基因家族成员,9号染色体上分布有2个SUS基因家族成员,3号和4号染色体分别有1个SUS基因家族成员。4
【机 构】
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金陵科技学院园艺园林学院,南京市江宁区农业农村局
【基金项目】
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国家自然科学基金(31801858),金陵科技学院“科教融合”项目(2020KJRH39),金陵科技学院高层次人才科研启动基金(jit-b-202009)。
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利用生物信息学方法,对萝卜全基因组SUS基因家族成员进行鉴定与表达分析,结果表明:1)从萝卜基因组中鉴定出7个SUS基因家族成员,且每个家族成员均包含3个保守基序,外显子数量为11~14个。2)根据进化树聚类结果,7个SUS基因家族成员可分为3大类,即SUSⅠ、SUSⅡ和SUSⅢ,它们分别包含2个、2个和3个SUS基因家族成员。3)这7个SUS基因家族成员分布在4条染色体上,7号染色体上分布有3个SUS基因家族成员,9号染色体上分布有2个SUS基因家族成员,3号和4号染色体分别有1个SUS基因家族成员。4
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