,Genome Engineering in Rice Using Cas9 Variants that Recognize NG PAM Sequences

来源 :分子植物(英文版) | 被引量 : 0次 | 上传用户:begoodboy
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
CRISPR/Cas9 genome editing relies on sgRNA-target DNA base pairing and a short downstream PAM sequence to recognize target DNA.The strict protospacer adjacent motif (PAM) requirement hinders applications of the CRISPR/Cas9 system since it restricts the targetable sites in the genomes,xCas9 and SpCas9-NG are two recently engineered SpCas9 variants that can recognize more relaxed NG PAMs,implying a great potential in addressing the issue of PAM constraint.Here we use stable transgenic lines to evaluate the efficacies of xCas9 and SpCas9-NG in performing gene editing and base editing in rice.We found that xCas9 can efficiently induce mutations at target sites with NG and GAT PAM sequences in rice.However,base editors containing xCas9 failed to edit most of the tested target sites.SpCas9-NG exhibited a robust editing activity at sites with various NG PAMs without showing any preference for the third nucleotide after NG.Moreover,we showed that xCas9 and SpCas9-NG have higher specificity than SpCas9 at the CGG PAM site.We further demonstrated that different forms of cytosine or adenine base editors containing SpCas9-NG worked efficiently in rice with broadened PAM compatibility.Taken together,our work has yielded versatile genome-engineering tools that will significantly expand the target scope in rice and other crops.
其他文献
通讯员都怕费了好多心血写成的稿件被编辑一个条子退回来。一接到退条,有些作者往往垂头丧气,怨天尤人。有些好象还觉得自尊心受到了伤害,有的干脆抱怨编辑不识货。其实那是
中国拥有丰富的药用植物资源,是利用中药历史最悠久的国家之一。近年来由于西药毒副作用的不断出现,人们把目光均转向资源丰富、疗效独特、毒副作用小的中药材,在世界范围内天然
通过对北京观光农业的调查和对国内外观光农业发展的动态分析表明:观光农业是农业、生态、旅游业可持续发展和"大地园林化"思想的必然要求,同时指出了当前观光农业规划的现状
桑树多倍体育种的研究,日本、苏联开展较早,积累了许多资料。一般认为四倍体桑叶形大、叶肉厚、叶质好、饲料效率高,但发条数少,枝条伸长短。产桑量低,孕性差,未能直接用于
基于CDMA技术的Ad hoc网络扩频码的分配方案对系统吞吐量性能有着重要的影响,如何充分利用CDMA多址接入能力提高Ad hoc信道利用率等网络性能,是一项具有很强挑战性的研究。通
山区森林地区的架空光缆不仅经常受到鼠类动物的啃咬,还常遭受鸟枪射击,因此在选用光缆时需综合考虑光缆的防枪击性能。在国家标准GB/T 7424.2—2008的枪击试验基础上,进行了
为了解我国石油污染土壤现状以及石油污染对土壤理化性质、微生物的影响,并在此基础上对石油污染土壤进行生物修复,本文开展了以下几方面的研究工作:(1)根据油田的产量以及地理
广播的特点是声音。“声”是广播最根本的优势。这个“声”,不仅是指播音员准确、优美、恰到好处的播音表达,更多的是指新闻事件的实况音响和新闻人物的活动、讲话等声音。
华南地区地域辽阔,温热多雨,大豆(Glycinemax(L)Merr.)在该区每年可以进行多造种植,具有很大的生产潜力。但是长久以来大豆在华南地区一直都是个弱势产业,播种面积仅占到全国的2.8%,
豆科和禾本科作物轮作和间作是常见的农业生产措施。豆科和禾本科作物在株型和营养特性上差异很大,合理搭配后进行轮作和间作,对高效利用资源,增产增收有重要作用。越来越多的研