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利用来源于药用野生稻（CC基因组）的中高度重复序列Cot-1 DNA作为探针，在相同的洗脱严谨度下．通过荧光原位杂交（FISH）对3种基因组同为CCDD的异源多倍体野生稻，宽叶野生稻（D．latifolia）、高杆野生稻（O．alta）、大颖野生稻（O．grandiglumis）进行基因组比较分析．结果发现：在80％的洗脱严谨度下，杂交信号在宽叶野生稻的C、D基因组上的分布差异较为明显，可以区分24条来源于C基因组的染色体和24条来自于D基因组的染色体；相同洗脱度下的高杆野生稻和大颖野生稻的C、D基因组则