利用GEO在线数据构建脑胶质母细胞瘤ceRNA网络

来源 :中国实用神经疾病杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wumin0371
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目的 构建胶质母细胞瘤(GBM)ceRNA调控网络,探讨其发病机制。方法 利用GSE103229数据集的芯片数据,分析GBM中异常表达的lncRNA、mRNA和miRNA,差异基因判定标准为logFC>1,P<0.05。通过数据库分析三者之间的靶向调控关系,构建ceRNA网络并用Cytoscape软件可视化。结果 GBM差异基因中,lncRNA1326个,癌组织中上调743个,下调583个;差异mRNA3743个,癌组织中上调1865个,下调1878个;差异miRNA33个,上调9个,下调24
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