对云南省柯萨奇病毒B组2型(coxsackievirus B2，CV-B2)不同时间分离的15株病毒VP1区3′端编码序列基因特征进行分析。
方法对云南省2005—2006年从急性迟缓性麻痹(acute flaccid paralysis，AFP)病例、2013年从健康儿童和2014年从手足口病(hand，foot and mouth disease，HFMD)病例中分离到的15株CV-B2的VP1区3′端进行基因扩增和测序；根据文献从GenBank下载CV-B2 VP1编码序列作为参考序列，用MEGA5.2软件计算不同毒株间的核苷酸(nucleotide，nt)和氨基酸(amino acid，aa)差异率，并构建系统进化树，进行VP1区3′端编码序列基因特征和分子流行病学分析。
结果2005年云南省从232例AFP病例中分离到1株CV-B2，2006年从240例AFP病例中分离到1株CV-B2，2013年从400名健康儿童中分离到12株CV-B2，2014年从500例HFMD病例中分离到1株CV-B2。对15株CV-B2基因特征分析表明，CV-B2可分为5个基因型。基因型1(genotype 1)由原型株(prototype)Ohio-1和1988年中国台湾分离株01-1组成；基因型2由2006、2007和2010年法国株组成；基因型3由云南株、山东株、河南株、福建株和中国台湾株组成；基因型4由俄罗斯分离株、云南2005及2006年AFP分离株和印度株组成；基因型5由中国台湾分离株、山东株和澳大利亚新南威尔士株组成。CV-B2的基因型分布具有地理多样性的特点。
结论云南省从健康儿童中分离的12株和从HFMD病例中分离到的1株CV-B2为基因型3，从AFP病例中分离到的2株CV-B2为基因型4。健康儿童分离株与HFMD分离株之间的nt差异率仅为0.76%，aa差异率仅为0.03%，它们具有同一进化来源。而健康儿童分离株、HFMD分离株(基因型3)与2005年、2006年两株AFP分离株(基因型4)的nt差异率为15.11%和15.25%，aa差异率为2.76%和2.72%。CV-B2与AFP和HFMD的致病关系值得深入研究。